Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 CDC1YDR182W 1476 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 RRP9YPR137W 1722 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YHK8YHR048W 1545 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YRB2YIL063C 984 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YMR122CYMR122C 375 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 SLD7YOR060C 774 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 MRPL23YOR150W 492 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YBR027CYBR027C 333 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YKR018CYKR018C 2178 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 ALR1YOL130W 2580 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 DAL7YIR031C 1665 nt8.26□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YCR041WYCR041W 333 nt8.25□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt8.25□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 BIM1YER016W 1035 nt8.25□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt8.25□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YAR064WYAR064W 300 nt8.25□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YLR463CYLR463C 552 nt8.25□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 TUF1YOR187W 1314 nt8.25□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YDR187CYDR187C 519 nt8.24□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 TDH2YJR009C 999 nt8.24□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YKR045CYKR045C 552 nt8.24□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 ATP10YLR393W 840 nt8.24□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 PRB1YEL060C 1908 nt8.24□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 GFA1YKL104C 2154 nt8.24□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 SEC24YIL109C 2781 nt8.23□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 ATG23YLR431C 1362 nt8.22□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YDL177CYDL177C 513 nt8.22□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YSC83YHR017W 1158 nt8.22□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 TAE1YBR261C 699 nt8.22□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 UIP5YKR044W 1332 nt8.22□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 GPD2YOL059W 1323 nt8.22□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 PPM2YOL141W 2088 nt8.22□□□□□ -1.09
NSE3Q05541 YDR401WYDR401W 564 nt8.21□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 SNF4YGL115W 969 nt8.21□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 CUP2YGL166W 678 nt8.21□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 AIM34YMR003W 597 nt8.21□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 SNT309YPR101W 528 nt8.21□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 YHR020WYHR020W 2067 nt8.21□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 CEM1YER061C 1329 nt8.21□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 YDR387CYDR387C 1668 nt8.21□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 COQ1YBR003W 1422 nt8.2□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 TRS31YDR472W 852 nt8.2□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 AMN1YBR158W 1650 nt8.2□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 HOS2YGL194C 1359 nt8.2□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 COX10YPL172C 1389 nt8.2□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 RRP46YGR095C 672 nt8.19□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 YLR112WYLR112W 420 nt8.19□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 AVO2YMR068W 1281 nt8.19□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 GDA1YEL042W 1557 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 TOD6YBL054W 1578 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 ITR1YDR497C 1755 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 MRPL28YDR462W 444 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 VMA3YEL027W 483 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 YML018CYML018C 1182 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 RNH201YNL072W 924 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 SCO2YBR024W 906 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 FSF1YOR271C 984 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 ZWF1YNL241C 1518 nt8.18□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 ATG36YJL185C 882 nt8.17□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 AST1YBL069W 1290 nt8.17□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 PAC2YER007W 1557 nt8.17□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 CCT8YJL008C 1707 nt8.16□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 TIF2YJL138C 1188 nt8.16□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 TIF1YKR059W 1188 nt8.16□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 YEN1YER041W 2280 nt8.15□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 AIM2YAL049C 741 nt8.15□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 SCS7YMR272C 1155 nt8.15□□□□□ -1.1
NSE3Q05541 CIR2YOR356W 1896 nt8.15□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 MSP1YGR028W 1089 nt8.14□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 MTR3YGR158C 753 nt8.14□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 CTF19YPL018W 1110 nt8.14□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 SIR2YDL042C 1689 nt8.14□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 ENP1YBR247C 1452 nt8.13□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 CHA1YCL064C 1083 nt8.13□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YMR295CYMR295C 594 nt8.13□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 POX1YGL205W 2247 nt8.13□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 REV7YIL139C 738 nt8.12□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YMR147WYMR147W 672 nt8.12□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 RFC4YOL094C 972 nt8.12□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 SMC5YOL034W 3282 nt8.12□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YER137CYER137C 447 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 COS6YGR295C 1146 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YHR140WYHR140W 720 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 MPC2YHR162W 390 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 RDN5-2RDN5-2 119 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 RDN5-3RDN5-3 119 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 RDN5-4RDN5-4 119 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 QRI5YLR204W 336 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 RDN5-5RDN5-5 119 nt8.11□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 PPH22YDL188C 1134 nt8.1□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YPL071CYPL071C 471 nt8.1□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 DPB2YPR175W 2070 nt8.1□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YMR279CYMR279C 1623 nt8.1□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt8.09□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 MRPL10YNL284C 969 nt8.09□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 YOR012WYOR012W 414 nt8.09□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 APM1YPL259C 1428 nt8.09□□□□□ -1.11
NSE3Q05541 NUP84YDL116W 2181 nt8.08□□□□□ -1.12
NSE3Q05541 FAL1YDR021W 1200 nt8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.8 ms