Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 MSG5YNL053W 1470 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX2Q04228 NUP57YGR119C 1626 nt7.78□□□□□ -1.16
UBX2Q04228 IRC5YFR038W 2562 nt7.77□□□□□ -1.16
UBX2Q04228 MPC2YHR162W 390 nt7.77□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 DSF1YEL070W 1509 nt7.77□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 YNR073CYNR073C 1509 nt7.77□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 CAN1YEL063C 1773 nt7.76□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 TIM22YDL217C 624 nt7.76□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 PPM2YOL141W 2088 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 PPH22YDL188C 1134 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 RFS1YBR052C 633 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 CCT8YJL008C 1707 nt7.75□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 COX10YPL172C 1389 nt7.74□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 ENB1YOL158C 1821 nt7.74□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 HVG1YER039C 750 nt7.74□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 EXG2YDR261C 1689 nt7.73□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 ACO1YLR304C 2337 nt7.73□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 UIP4YPL186C 915 nt7.73□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 CBR1YIL043C 855 nt7.72□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 ATG36YJL185C 882 nt7.72□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 MOG1YJR074W 657 nt7.72□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 CTF19YPL018W 1110 nt7.72□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 COQ1YBR003W 1422 nt7.71□□□□□ -1.17
UBX2Q04228 IVY1YDR229W 1362 nt7.71□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 TDP1YBR223C 1635 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 YCR061WYCR061W 1896 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 ERG1YGR175C 1491 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 YSC83YHR017W 1158 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 ZRT2YLR130C 1269 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 RUF23RUF23 254 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 SRF1YDL133W 1314 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 FCY2YER056C 1602 nt7.7□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 VTS1YOR359W 1572 nt7.69□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 URH1YDR400W 1023 nt7.69□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 YHR020WYHR020W 2067 nt7.69□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 YPR196WYPR196W 1413 nt7.69□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 YDL177CYDL177C 513 nt7.68□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 VPS24YKL041W 675 nt7.67□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 LOT6YLR011W 576 nt7.67□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 SEN34YAR008W 828 nt7.67□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 SGF29YCL010C 780 nt7.67□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 TUF1YOR187W 1314 nt7.67□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 LYS1YIR034C 1122 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 MSO1YNR049C 633 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 LYS21YDL131W 1323 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 PTC3YBL056W 1407 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 EMP65YER140W 1671 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 AGP2YBR132C 1791 nt7.66□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 NAS6YGR232W 687 nt7.65□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 CMK2YOL016C 1344 nt7.65□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 RFC4YOL094C 972 nt7.65□□□□□ -1.18
UBX2Q04228 FAL1YDR021W 1200 nt7.64□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 PSR2YLR019W 1194 nt7.64□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 AAT2YLR027C 1257 nt7.64□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 TSR3YOR006C 942 nt7.64□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 MEU1YLR017W 1014 nt7.63□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 YEL023CYEL023C 2049 nt7.62□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 YHL018WYHL018W 363 nt7.62□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 GUT1YHL032C 2130 nt7.62□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 SRL2YLR082C 1179 nt7.62□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.61□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 RQC1YDR333C 2172 nt7.61□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 SIT4YDL047W 936 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 YDL144CYDL144C 1071 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 SNF4YGL115W 969 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 ECM30YLR436C 3825 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 YOR012WYOR012W 414 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 YPL257WYPL257W 582 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 MLS1YNL117W 1665 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 RVB2YPL235W 1416 nt7.6□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 YCR041WYCR041W 333 nt7.59□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 YJR146WYJR146W 354 nt7.59□□□□□ -1.19
UBX2Q04228 NUP84YDL116W 2181 nt7.59□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 TRS31YDR472W 852 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 YJR084WYJR084W 1272 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 SNN1YNL086W 309 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 ENV7YPL236C 1095 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 SNT309YPR101W 528 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 SEC23YPR181C 2307 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 YDR306CYDR306C 1437 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 GPA2YER020W 1350 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 ERP5YHR110W 639 nt7.57□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 YLR112WYLR112W 420 nt7.57□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 KSH1YNL024C-A 219 nt7.57□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 OPI11YPR044C 354 nt7.57□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 PAC2YER007W 1557 nt7.57□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 TOS2YGR221C 1869 nt7.57□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 YDL172CYDL172C 480 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 YDL218WYDL218W 954 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 SDH4YDR178W 546 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 MRPL28YDR462W 444 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 EGD2YHR193C 525 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 OGG1YML060W 1131 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 HEL1YKR017C 1656 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 EFM1YHL039W 1758 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 CEM1YER061C 1329 nt7.55□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 SKY1YMR216C 2229 nt7.55□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 STF1YDL130W-A 261 nt7.55□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 PAC10YGR078C 600 nt7.55□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 AIM2YAL049C 741 nt7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 131.8 ms