Protein–RNA interactions for Protein: Q03973

HMO1, High mobility group protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMO1Q03973 ATP23YNR020C 813 nt6.75□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 MOD5YOR274W 1287 nt6.75□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 YIL092WYIL092W 1902 nt6.75□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 VBA5YKR105C 1749 nt6.75□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 YGL081WYGL081W 963 nt6.74□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 CDC16YKL022C 2523 nt6.74□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 VMA2YBR127C 1554 nt6.74□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 NOG2YNR053C 1461 nt6.73□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 TPK1YJL164C 1194 nt6.73□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 ADE1YAR015W 921 nt6.73□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 TAF4YMR005W 1167 nt6.73□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 DPB2YPR175W 2070 nt6.73□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 DAL4YIR028W 1908 nt6.72□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 BIM1YER016W 1035 nt6.72□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 HIS1YER055C 894 nt6.72□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 NMA2YGR010W 1188 nt6.72□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 LYS12YIL094C 1116 nt6.72□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 KNS1YLL019C 2214 nt6.72□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 SES1YDR023W 1389 nt6.71□□□□□ -1.33
HMO1Q03973 YDR415CYDR415C 1125 nt6.71□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 NCA3YJL116C 1014 nt6.71□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 TOS6YNL300W 309 nt6.71□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YNR048WYNR048W 1182 nt6.71□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 TRS31YDR472W 852 nt6.7□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YER147C-AYER147C-A 411 nt6.7□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 ERP5YHR110W 639 nt6.7□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.7□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YUR1YJL139C 1287 nt6.7□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YKR032WYKR032W 315 nt6.7□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 CTR1YPR124W 1221 nt6.7□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 CDC10YCR002C 969 nt6.69□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YDL177CYDL177C 513 nt6.69□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 SHO1YER118C 1104 nt6.69□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 CBR1YIL043C 855 nt6.69□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YOR300WYOR300W 309 nt6.69□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 MSI1YBR195C 1269 nt6.69□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 CDS1YBR029C 1374 nt6.69□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 BUD9YGR041W 1644 nt6.68□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 ENP1YBR247C 1452 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 TRP1YDR007W 675 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YML122CYML122C 381 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YNL200CYNL200C 741 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YNL234WYNL234W 1281 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 RTC4YNL254C 1206 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 IRC11YOR013W 471 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 DSE3YOR264W 1293 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 PET20YPL159C 762 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 ISC1YER019W 1434 nt6.67□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YDR476CYDR476C 675 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YEL074WYEL074W 339 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 YPT1YFL038C 621 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 COX5AYNL052W 462 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 MPE1YKL059C 1326 nt6.66□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 ARG81YML099C 2643 nt6.65□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 RRP46YGR095C 672 nt6.65□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 RPL31BYLR406C 342 nt6.65□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 MRPL24YMR193W 777 nt6.65□□□□□ -1.34
HMO1Q03973 TOS1YBR162C 1368 nt6.65□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 HEM1YDR232W 1647 nt6.65□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 AVT4YNL101W 2142 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 YOL079WYOL079W 399 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 YMR034CYMR034C 1305 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 NFS1YCL017C 1494 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 YPR204WYPR204W 3099 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 TKL2YBR117C 2046 nt6.64□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 snR78snR78 87 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 QCR6YFR033C 444 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 YHC3YJL059W 1227 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 ICS3YJL077C 396 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 REC107YJR021C 945 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 TUB1YML085C 1344 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 YNL017CYNL017C 339 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 FRE5YOR384W 2085 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 YBR226CYBR226C 411 nt6.63□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 YPQ2YDR352W 954 nt6.62□□□□□ -1.35
HMO1Q03973 RAI1YGL246C 1164 nt6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 98.4 ms