Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPS35P82673 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS35P82673 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRPS35P82673 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS35P82673 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS35P82673 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms