Protein–RNA interactions for Protein: P38344

REI1, Cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REI1P38344 MSG5YNL053W 1470 nt7.56□□□□□ -1.2
REI1P38344 SLA2YNL243W 2907 nt7.56□□□□□ -1.2
REI1P38344 MRPL28YDR462W 444 nt7.56□□□□□ -1.2
REI1P38344 NCA3YJL116C 1014 nt7.56□□□□□ -1.2
REI1P38344 YJR115WYJR115W 510 nt7.56□□□□□ -1.2
REI1P38344 OMA1YKR087C 1038 nt7.56□□□□□ -1.2
REI1P38344 TSR3YOR006C 942 nt7.56□□□□□ -1.2
REI1P38344 HBN1YCL026C-B 582 nt7.56□□□□□ -1.2
REI1P38344 YBR241CYBR241C 1467 nt7.55□□□□□ -1.2
REI1P38344 TRP1YDR007W 675 nt7.55□□□□□ -1.2
REI1P38344 ADD66YKL206C 804 nt7.55□□□□□ -1.2
REI1P38344 ADE1YAR015W 921 nt7.55□□□□□ -1.2
REI1P38344 RRN10YBL025W 438 nt7.55□□□□□ -1.2
REI1P38344 SMK1YPR054W 1167 nt7.55□□□□□ -1.2
REI1P38344 EDC3YEL015W 1656 nt7.54□□□□□ -1.2
REI1P38344 YDL158CYDL158C 309 nt7.54□□□□□ -1.2
REI1P38344 HPT1YDR399W 666 nt7.54□□□□□ -1.2
REI1P38344 VAM3YOR106W 852 nt7.54□□□□□ -1.2
REI1P38344 SDH8YBR269C 417 nt7.54□□□□□ -1.2
REI1P38344 GFD1YMR255W 567 nt7.53□□□□□ -1.2
REI1P38344 ADH6YMR318C 1083 nt7.53□□□□□ -1.2
REI1P38344 CIT2YCR005C 1383 nt7.53□□□□□ -1.2
REI1P38344 SRL2YLR082C 1179 nt7.52□□□□□ -1.21
REI1P38344 DSC2YOL073C 969 nt7.52□□□□□ -1.21
REI1P38344 RRP40YOL142W 723 nt7.52□□□□□ -1.21
REI1P38344 ISA2YPR067W 558 nt7.52□□□□□ -1.21
REI1P38344 SNU71YGR013W 1863 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 DAL7YIR031C 1665 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 MED2YDL005C 1296 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 MHO1YJR008W 1017 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 YAL045CYAL045C 309 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 YNL319WYNL319W 441 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 DPM1YPR183W 804 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 MSI1YBR195C 1269 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 SLX1YBR228W 915 nt7.51□□□□□ -1.21
REI1P38344 YHR022CYHR022C 771 nt7.5□□□□□ -1.21
REI1P38344 YNR014WYNR014W 639 nt7.5□□□□□ -1.21
REI1P38344 YGL081WYGL081W 963 nt7.49□□□□□ -1.21
REI1P38344 SAS4YDR181C 1446 nt7.49□□□□□ -1.21
REI1P38344 MRP1YDR347W 966 nt7.48□□□□□ -1.21
REI1P38344 YKR075CYKR075C 924 nt7.48□□□□□ -1.21
REI1P38344 YOL099CYOL099C 492 nt7.48□□□□□ -1.21
REI1P38344 OST3YOR085W 1053 nt7.48□□□□□ -1.21
REI1P38344 OPI11YPR044C 354 nt7.48□□□□□ -1.21
REI1P38344 TAZ1YPR140W 1146 nt7.48□□□□□ -1.21
REI1P38344 YCR061WYCR061W 1896 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 RSP5YER125W 2430 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 YDR476CYDR476C 675 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 ATP6Q0085 780 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 ERP5YHR110W 639 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 RTC4YNL254C 1206 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 GPI18YBR004C 1302 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 SMC5YOL034W 3282 nt7.47□□□□□ -1.21
REI1P38344 WHI4YDL224C 1950 nt7.46□□□□□ -1.21
REI1P38344 DML1YMR211W 1428 nt7.46□□□□□ -1.21
REI1P38344 YLR169WYLR169W 354 nt7.46□□□□□ -1.22
REI1P38344 HEL1YKR017C 1656 nt7.46□□□□□ -1.22
REI1P38344 RGD2YFL047W 2145 nt7.46□□□□□ -1.22
REI1P38344 TUF1YOR187W 1314 nt7.46□□□□□ -1.22
REI1P38344 ECM38YLR299W 1983 nt7.46□□□□□ -1.22
REI1P38344 PAC2YER007W 1557 nt7.46□□□□□ -1.22
REI1P38344 BDF2YDL070W 1917 nt7.45□□□□□ -1.22
REI1P38344 GRH1YDR517W 1119 nt7.45□□□□□ -1.22
REI1P38344 CLB5YPR120C 1308 nt7.45□□□□□ -1.22
REI1P38344 snR57snR57 88 nt7.44□□□□□ -1.22
REI1P38344 YHR131CYHR131C 2553 nt7.43□□□□□ -1.22
REI1P38344 PPH22YDL188C 1134 nt7.43□□□□□ -1.22
REI1P38344 GTT3YEL017W 1014 nt7.43□□□□□ -1.22
REI1P38344 OPI8YKR035C 642 nt7.43□□□□□ -1.22
REI1P38344 YKR104WYKR104W 921 nt7.43□□□□□ -1.22
REI1P38344 YML122CYML122C 381 nt7.43□□□□□ -1.22
REI1P38344 YOL107WYOL107W 1029 nt7.43□□□□□ -1.22
REI1P38344 MUM3YOR298W 1440 nt7.43□□□□□ -1.22
REI1P38344 MIP1YOR330C 3765 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 SKY1YMR216C 2229 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 TRS31YDR472W 852 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 HSP12YFL014W 330 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 DOC1YGL240W 753 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 YHR054CYHR054C 1065 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 PHA2YNL316C 1005 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 HEM15YOR176W 1182 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 ARP3YJR065C 1350 nt7.42□□□□□ -1.22
REI1P38344 YGR066CYGR066C 879 nt7.41□□□□□ -1.22
REI1P38344 BUD20YLR074C 501 nt7.41□□□□□ -1.22
REI1P38344 YLR198CYLR198C 360 nt7.41□□□□□ -1.22
REI1P38344 RPL5YPL131W 894 nt7.41□□□□□ -1.22
REI1P38344 UBS1YBR165W 834 nt7.41□□□□□ -1.22
REI1P38344 TOS1YBR162C 1368 nt7.41□□□□□ -1.22
REI1P38344 ACO1YLR304C 2337 nt7.4□□□□□ -1.22
REI1P38344 FSH1YHR049W 732 nt7.4□□□□□ -1.22
REI1P38344 ALG5YPL227C 1005 nt7.4□□□□□ -1.22
REI1P38344 RTG3YBL103C 1461 nt7.39□□□□□ -1.23
REI1P38344 NFS1YCL017C 1494 nt7.39□□□□□ -1.23
REI1P38344 YCR006CYCR006C 474 nt7.39□□□□□ -1.23
REI1P38344 TRP4YDR354W 1143 nt7.39□□□□□ -1.23
REI1P38344 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms