Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms