Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARGC1BQ86YN6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARGC1BQ86YN6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPARGC1BQ86YN6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPARGC1BQ86YN6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPARGC1BQ86YN6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARGC1BQ86YN6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms