Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 526.29■■□□□ 1.82e-8■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.242e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 SETD5-214ENST00000463180 685 ntTSL 221.95■■□□□ 1.12e-8■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 317.38■□□□□ 0.372e-8■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-8■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-8■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.392e-29■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 P4HB-208ENST00000473021 914 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.382e-20■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.342e-6■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.96■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 COMT-211ENST00000493893 354 ntTSL 315.33■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 420.83■□□□□ 0.931e-7■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 317.4■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 217.31■□□□□ 0.361e-7■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PLEKHH3-203ENST00000587627 1047 ntTSL 525.69■■□□□ 1.74e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.574e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 HHEX-204ENST00000551454 1307 ntTSL 1 (best)23.01■■□□□ 1.274e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.824e-9■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.514e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.494e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PLEKHH3-207ENST00000591490 4339 ntTSL 216.6■□□□□ 0.254e-9■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 FAM53C-208ENST00000511276 571 ntTSL 414.73□□□□□ -0.054e-9■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.014e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 AZIN1-204ENST00000518353 773 ntTSL 57.84□□□□□ -1.154e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.744e-9■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-9■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 F2-204ENST00000490274 545 ntTSL 315.54■□□□□ 0.081e-9■□□□□ 9.3
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PCBP1Q15365 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.313e-33■□□□□ 9.3
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PCBP1Q15365 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-11■□□□□ 9.3
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PCBP1Q15365 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 211.53□□□□□ -0.562e-11■□□□□ 9.3
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PCBP1Q15365 YWHAE-206ENST00000496706 732 ntTSL 37.75□□□□□ -1.172e-11■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 GSN-201ENST00000373806 879 ntTSL 220.87■□□□□ 0.934e-9■□□□□ 9.3
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PCBP1Q15365 SLC6A8-208ENST00000467402 308 ntTSL 513.28□□□□□ -0.281e-15■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-16■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 MLLT6-202ENST00000612066 527 ntTSL 214.7□□□□□ -0.066e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 VASP-202ENST00000586014 1725 ntTSL 521.32■■□□□ 12e-6■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 VASP-207ENST00000588482 804 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-204ENST00000482718 541 ntTSL 229.49■■■□□ 2.311e-7■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-206ENST00000491109 637 ntTSL 215.16■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-202ENST00000339643 633 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.557e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-213ENST00000509582 716 ntTSL 310.75□□□□□ -0.697e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.867e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.127e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.27e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.237e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-212ENST00000505321 552 ntTSL 56.19□□□□□ -1.427e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.597e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.757e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 MAN2A2-225ENST00000560880 718 ntTSL 28.15□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 SERPINF1-208ENST00000572517 672 ntTSL 212.88□□□□□ -0.353e-14■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 APOA2-202ENST00000463273 469 ntTSL 1 (best)10.16□□□□□ -0.782e-45■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-21■□□□□ 9.1
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