Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 314.33□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 514.33□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 314.01□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 413.91□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 513.82□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 413.34□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 413.26□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 39.32□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 48.93□□□□□ -0.982e-6■■□□□ 14.4
UTP18Q9Y5J1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.625e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 227.44■■□□□ 1.985e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.455e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.125e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 521.73■■□□□ 1.075e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.065e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-229ENST00000492127 1153 ntTSL 220.93■□□□□ 0.945e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 220.91■□□□□ 0.945e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.835e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 419.67■□□□□ 0.745e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.715e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-218ENST00000450497 882 ntTSL 519.28■□□□□ 0.685e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.085e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-208ENST00000423004 773 ntTSL 215.46■□□□□ 0.075e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-226ENST00000479442 511 ntTSL 214.11□□□□□ -0.155e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 312.55□□□□□ -0.45e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-233ENST00000496159 463 ntTSL 211.71□□□□□ -0.535e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 310□□□□□ -0.815e-10■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.993e-23■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 PKD1-221ENST00000488185 737 ntTSL 521.56■■□□□ 1.041e-5■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 521.17■□□□□ 0.981e-5■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 PKD1-235ENST00000568591 2545 ntTSL 220.18■□□□□ 0.821e-5■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 517■□□□□ 0.311e-5■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.114e-6■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.074e-6■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 514.42□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.144e-6■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.24e-6■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.314e-6■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.334e-6■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-5■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-5■■□□□ 14.3
UTP18Q9Y5J1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.635e-6■■□□□ 14.2
UTP18Q9Y5J1 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 518.7■□□□□ 0.586e-7■■□□□ 14.1
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 218.12■□□□□ 0.494e-7■■□□□ 14
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 316.5■□□□□ 0.234e-7■■□□□ 14
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 315.68■□□□□ 0.14e-7■■□□□ 14
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-242ENST00000531953 506 ntTSL 412.96□□□□□ -0.334e-7■■□□□ 14
UTP18Q9Y5J1 EEF1D-213ENST00000526133 367 ntTSL 210.21□□□□□ -0.774e-7■■□□□ 14
UTP18Q9Y5J1 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-17■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-203ENST00000470714 868 ntTSL 318.16■□□□□ 0.54e-7■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-202ENST00000444874 2661 ntTSL 215.78■□□□□ 0.124e-7■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-205ENST00000483329 819 ntTSL 512.89□□□□□ -0.354e-7■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-204ENST00000472646 553 ntTSL 512.18□□□□□ -0.464e-7■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.514e-7■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 FASN-210ENST00000636968 100 ntTSL 517.67■□□□□ 0.422e-9■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 212.76□□□□□ -0.371e-6■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 25.93□□□□□ -1.461e-6■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-209ENST00000479007 1855 ntTSL 221.6■■□□□ 1.051e-7■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-212ENST00000487187 764 ntTSL 519.39■□□□□ 0.691e-7■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 219.19■□□□□ 0.661e-7■■□□□ 13.9
UTP18Q9Y5J1 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.852e-8■■□□□ 13.8
UTP18Q9Y5J1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.28e-18■■□□□ 13.8
UTP18Q9Y5J1 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 213.94□□□□□ -0.188e-18■■□□□ 13.8
UTP18Q9Y5J1 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.358e-18■■□□□ 13.8
UTP18Q9Y5J1 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.078e-18■■□□□ 13.8
UTP18Q9Y5J1 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 518.2■□□□□ 0.55e-7■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.342e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.962e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 216.45■□□□□ 0.222e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FADS3-210ENST00000531956 841 ntTSL 516.23■□□□□ 0.192e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 316.05■□□□□ 0.162e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FADS3-212ENST00000534223 800 ntTSL 513.19□□□□□ -0.32e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FLVCR2-205ENST00000554496 441 ntTSL 312.99□□□□□ -0.332e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 FLVCR2-209ENST00000555385 218 ntTSL 410.13□□□□□ -0.792e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.952e-8■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.44e-6■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 EEF2-205ENST00000598436 549 ntTSL 213.73□□□□□ -0.211e-16■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-16■■□□□ 13.7
UTP18Q9Y5J1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.81e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.931e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.741e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 UBALD1-204ENST00000588691 281 ntTSL 325.7■■□□□ 1.71e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.441e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 UBALD1-207ENST00000591113 659 ntTSL 523.52■■□□□ 1.361e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.331e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.271e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.821e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 ZNF331-219ENST00000513929 1424 ntTSL 219.87■□□□□ 0.771e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 KPNB1-205ENST00000577918 859 ntTSL 315.5■□□□□ 0.075e-8■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 KPNB1-214ENST00000583648 896 ntTSL 415.24■□□□□ 0.035e-8■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.091e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 13.6
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