RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488185.2

PKD1-221, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 5

Gene PKD1, Length 737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-221ENST00000488185 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.42■■■■■ 5.66
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PKD1-221ENST00000488185 ABCC9O60706 1549 aa44.23■■■■■ 4.67
PKD1-221ENST00000488185 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.48■■■■■ 4.39
PKD1-221ENST00000488185 NACADO15069 1562 aa42.4■■■■■ 4.38
PKD1-221ENST00000488185 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.16■■■■■ 4.34
PKD1-221ENST00000488185 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.09■■■■■ 4.33
PKD1-221ENST00000488185 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
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PKD1-221ENST00000488185 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.38■■■■■ 4.22
PKD1-221ENST00000488185 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.2
PKD1-221ENST00000488185 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.22■■■■■ 4.19
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PKD1-221ENST00000488185 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.9■■■■■ 4.14
PKD1-221ENST00000488185 SCRIBQ14160 1630 aa40.85■■■■■ 4.13
PKD1-221ENST00000488185 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
PKD1-221ENST00000488185 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.03■■■■■ 4
PKD1-221ENST00000488185 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.85■■■■□ 3.97
PKD1-221ENST00000488185 NCAPD3P42695 1498 aa39.18■■■■□ 3.86
PKD1-221ENST00000488185 SMARCA4P51532 1647 aa39.14■■■■□ 3.86
PKD1-221ENST00000488185 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
PKD1-221ENST00000488185 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.08■■■■□ 3.85
PKD1-221ENST00000488185 SMARCA2P51531 1590 aa39.01■■■■□ 3.84
PKD1-221ENST00000488185 HMGXB3Q12766 1538 aa38.89■■■■□ 3.82
PKD1-221ENST00000488185 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.88■■■■□ 3.81
PKD1-221ENST00000488185 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.79■■■■□ 3.8
PKD1-221ENST00000488185 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
PKD1-221ENST00000488185 WIZO95785 1651 aa38.29■■■■□ 3.72
PKD1-221ENST00000488185 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
PKD1-221ENST00000488185 NESP48681 1621 aa38.18■■■■□ 3.7
PKD1-221ENST00000488185 ERCC6Q03468 1493 aa38.15■■■■□ 3.7
PKD1-221ENST00000488185 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.13■■■■□ 3.69
PKD1-221ENST00000488185 CUX2O14529 1486 aa38.01■■■■□ 3.67
PKD1-221ENST00000488185 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.98■■■■□ 3.67
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PKD1-221ENST00000488185 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.91■■■■□ 3.66
PKD1-221ENST00000488185 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
PKD1-221ENST00000488185 CFTRP13569 1480 aa37.69■■■■□ 3.62
PKD1-221ENST00000488185 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.66■■■■□ 3.62
PKD1-221ENST00000488185 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.52■■■■□ 3.6
PKD1-221ENST00000488185 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.49■■■■□ 3.59
PKD1-221ENST00000488185 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.47■■■■□ 3.59
PKD1-221ENST00000488185 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.45■■■■□ 3.59
PKD1-221ENST00000488185 WDR62O43379 1518 aa37.4■■■■□ 3.58
PKD1-221ENST00000488185 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.29■■■■□ 3.56
PKD1-221ENST00000488185 PRDM2Q13029 1718 aa37.21■■■■□ 3.55
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PKD1-221ENST00000488185 ABCC8Q09428 1581 aa36.91■■■■□ 3.5
PKD1-221ENST00000488185 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
PKD1-221ENST00000488185 TOPBP1Q92547 1522 aa36.84■■■■□ 3.49
PKD1-221ENST00000488185 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.76■■■■□ 3.48
PKD1-221ENST00000488185 IFT140Q96RY7 1462 aa36.74■■■■□ 3.47
PKD1-221ENST00000488185 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
PKD1-221ENST00000488185 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
PKD1-221ENST00000488185 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
PKD1-221ENST00000488185 CUX1P39880 1505 aa36.42■■■■□ 3.42
PKD1-221ENST00000488185 OSCARQ8IYS5 282 aa36.37■■■■□ 3.41
PKD1-221ENST00000488185 SOGA1O94964 1423 aa36.36■■■■□ 3.41
PKD1-221ENST00000488185 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.34■■■■□ 3.41
PKD1-221ENST00000488185 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PKD1-221ENST00000488185 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.31■■■■□ 3.4
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PKD1-221ENST00000488185 WDR97A6NE52 1622 aa36.24■■■■□ 3.39
PKD1-221ENST00000488185 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
PKD1-221ENST00000488185 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.37
PKD1-221ENST00000488185 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.04■■■■□ 3.36
PKD1-221ENST00000488185 TOP2BQ02880 1626 aa36.02■■■■□ 3.36
PKD1-221ENST00000488185 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.01■■■■□ 3.35
PKD1-221ENST00000488185 GRIN2BQ13224 1484 aa35.99■■■■□ 3.35
PKD1-221ENST00000488185 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
PKD1-221ENST00000488185 SYNJ1O43426 1573 aa35.94■■■■□ 3.34
PKD1-221ENST00000488185 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.93■■■■□ 3.34
PKD1-221ENST00000488185 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.92■■■■□ 3.34
PKD1-221ENST00000488185 CHD1O14646 1710 aa35.88■■■■□ 3.34
PKD1-221ENST00000488185 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.87■■■■□ 3.33
PKD1-221ENST00000488185 FBLN2P98095 1184 aa35.84■■■■□ 3.33
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PKD1-221ENST00000488185 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
PKD1-221ENST00000488185 PBRM1Q86U86 1689 aa35.75■■■■□ 3.31
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PKD1-221ENST00000488185 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
PKD1-221ENST00000488185 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
PKD1-221ENST00000488185 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
PKD1-221ENST00000488185 TRIM41Q8WV44 630 aa35.69■■■■□ 3.3
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PKD1-221ENST00000488185 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.6■■■■□ 3.29
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PKD1-221ENST00000488185 ADAMTS12P58397 1594 aa35.53■■■■□ 3.28
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PKD1-221ENST00000488185 NUP160Q12769 1436 aa35.42■■■■□ 3.26
PKD1-221ENST00000488185 ARAP1Q96P48 1450 aa35.4■■■■□ 3.26
PKD1-221ENST00000488185 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.38■■■■□ 3.25
PKD1-221ENST00000488185 KIF27Q86VH2 1401 aa35.37■■■■□ 3.25
PKD1-221ENST00000488185 IGF1RP08069 1367 aa35.31■■■■□ 3.24
PKD1-221ENST00000488185 CEP170Q5SW79 1584 aa35.3■■■■□ 3.24
PKD1-221ENST00000488185 SHROOM2Q13796 1616 aa35.16■■■■□ 3.22
PKD1-221ENST00000488185 CUL7Q14999 1698 aa35.14■■■■□ 3.22
PKD1-221ENST00000488185 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.05■■■■□ 3.2
PKD1-221ENST00000488185 JPH4Q96JJ6 628 aa35.04■■■■□ 3.2
PKD1-221ENST00000488185 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.03■■■■□ 3.2
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