Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBCCD1Q9NVR7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms