Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 GEF1YJR040W 2340 nt6.84□□□□□ -1.31
NFI1Q12216 FCY2YER056C 1602 nt6.84□□□□□ -1.31
NFI1Q12216 SPR1YOR190W 1338 nt6.84□□□□□ -1.31
NFI1Q12216 YKL147CYKL147C 618 nt6.84□□□□□ -1.31
NFI1Q12216 LIP5YOR196C 1245 nt6.84□□□□□ -1.31
NFI1Q12216 PAT1YCR077C 2391 nt6.84□□□□□ -1.31
NFI1Q12216 QNS1YHR074W 2145 nt6.83□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 PNS1YOR161C 1620 nt6.83□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 ELP4YPL101W 1371 nt6.83□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 RRP46YGR095C 672 nt6.83□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 SUR7YML052W 909 nt6.83□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 OPI11YPR044C 354 nt6.83□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 LSG1YGL099W 1923 nt6.82□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 RMD9YGL107C 1941 nt6.82□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 PSA1YDL055C 1086 nt6.82□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 FZF1YGL254W 900 nt6.82□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 NCA3YJL116C 1014 nt6.82□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 ERG24YNL280C 1317 nt6.81□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 HAC1YFL031W 717 nt6.81□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 RPL2BYIL018W 765 nt6.81□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 YPT10YBR264C 600 nt6.81□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 BUD9YGR041W 1644 nt6.8□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 CHS5YLR330W 2016 nt6.8□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 TAD2YJL035C 753 nt6.79□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 CPT1YNL130C 1182 nt6.79□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 HXT17YNR072W 1695 nt6.79□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 YFR006WYFR006W 1608 nt6.79□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 NUP57YGR119C 1626 nt6.79□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 SAC6YDR129C 1929 nt6.78□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 EXG2YDR261C 1689 nt6.78□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 YAL045CYAL045C 309 nt6.78□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 ERV2YPR037C 591 nt6.78□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 MPA43YNL249C 1629 nt6.78□□□□□ -1.32
NFI1Q12216 DSC3YOR223W 879 nt6.77□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 ARC35YNR035C 1029 nt6.76□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 GDH1YOR375C 1365 nt6.76□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 RDR1YOR380W 1641 nt6.76□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 YPR204WYPR204W 3099 nt6.75□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 SKP1YDR328C 585 nt6.75□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 COG1YGL223C 1254 nt6.75□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 MCH2YKL221W 1422 nt6.75□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 NUP53YMR153W 1428 nt6.75□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 KEL1YHR158C 3495 nt6.74□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 GAA1YLR088W 1845 nt6.74□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 STS1YIR011C 960 nt6.74□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 YBR124WYBR124W 360 nt6.74□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 PCS60YBR222C 1632 nt6.74□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 OSM1YJR051W 1506 nt6.74□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 YDR387CYDR387C 1668 nt6.74□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 JIP4YDR475C 2631 nt6.73□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 ESC8YOL017W 2145 nt6.73□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 SPS22YCL048W 1392 nt6.73□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 ADE1YAR015W 921 nt6.73□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 BZZ1YHR114W 1902 nt6.72□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 RIX7YLL034C 2514 nt6.72□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 SUB2YDL084W 1341 nt6.72□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 CDC7YDL017W 1524 nt6.71□□□□□ -1.33
NFI1Q12216 YIA6YIL006W 1122 nt6.71□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 CIS3YJL158C 684 nt6.71□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 YJR142WYJR142W 1029 nt6.71□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 TEL2YGR099W 2067 nt6.71□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 XBP1YIL101C 1944 nt6.71□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 YFL052WYFL052W 1398 nt6.7□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 CDC3YLR314C 1563 nt6.7□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 MRP1YDR347W 966 nt6.7□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 CMR1YDL156W 1569 nt6.69□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 STE13YOR219C 2796 nt6.69□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 TFC6YDR362C 2019 nt6.69□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 PGI1YBR196C 1665 nt6.69□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 HSP150YJL159W 1242 nt6.69□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 HRB1YNL004W 1365 nt6.69□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 LAT1YNL071W 1449 nt6.68□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 ELP3YPL086C 1674 nt6.68□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 CDC11YJR076C 1248 nt6.68□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 CCW12YLR110C 402 nt6.68□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 YMR074CYMR074C 438 nt6.68□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 CWC27YPL064C 906 nt6.68□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 OPT1YJL212C 2400 nt6.68□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 CRZ1YNL027W 2037 nt6.67□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 MRP51YPL118W 1035 nt6.67□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 IRC5YFR038W 2562 nt6.67□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 YMR279CYMR279C 1623 nt6.67□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.66□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 NMA2YGR010W 1188 nt6.66□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 HOG1YLR113W 1308 nt6.66□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 TAH11YJR046W 1815 nt6.66□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 YOL036WYOL036W 2286 nt6.65□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 IMA5YJL216C 1746 nt6.65□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 PPM1YDR435C 987 nt6.65□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 OPI8YKR035C 642 nt6.65□□□□□ -1.34
NFI1Q12216 KDX1YKL161C 1302 nt6.65□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 CIT2YCR005C 1383 nt6.65□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 TRP5YGL026C 2124 nt6.65□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 CCT3YJL014W 1605 nt6.65□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 PAP2YOL115W 1755 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 GUF1YLR289W 1938 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 ERS1YCR075C 783 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 YDR476CYDR476C 675 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.64□□□□□ -1.35
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