Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 CYS3YAL012W 1185 nt7.37□□□□□ -1.23
SND1Q04007 YKL147CYKL147C 618 nt7.37□□□□□ -1.23
SND1Q04007 MBF1YOR298C-A 456 nt7.37□□□□□ -1.23
SND1Q04007 YOS9YDR057W 1629 nt7.37□□□□□ -1.23
SND1Q04007 ATF1YOR377W 1578 nt7.37□□□□□ -1.23
SND1Q04007 NFS1YCL017C 1494 nt7.36□□□□□ -1.23
SND1Q04007 AQR1YNL065W 1761 nt7.36□□□□□ -1.23
SND1Q04007 AFG2YLR397C 2343 nt7.35□□□□□ -1.23
SND1Q04007 JIP4YDR475C 2631 nt7.35□□□□□ -1.23
SND1Q04007 YER137CYER137C 447 nt7.35□□□□□ -1.23
SND1Q04007 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SND1Q04007 POB3YML069W 1659 nt7.34□□□□□ -1.23
SND1Q04007 AIM46YHR199C 933 nt7.33□□□□□ -1.24
SND1Q04007 RTC4YNL254C 1206 nt7.33□□□□□ -1.24
SND1Q04007 DPM1YPR183W 804 nt7.33□□□□□ -1.24
SND1Q04007 FRT1YOR324C 1809 nt7.33□□□□□ -1.24
SND1Q04007 PAP2YOL115W 1755 nt7.33□□□□□ -1.24
SND1Q04007 MPE1YKL059C 1326 nt7.32□□□□□ -1.24
SND1Q04007 FCY2YER056C 1602 nt7.32□□□□□ -1.24
SND1Q04007 FZF1YGL254W 900 nt7.32□□□□□ -1.24
SND1Q04007 URA1YKL216W 945 nt7.32□□□□□ -1.24
SND1Q04007 LIP5YOR196C 1245 nt7.32□□□□□ -1.24
SND1Q04007 RDR1YOR380W 1641 nt7.31□□□□□ -1.24
SND1Q04007 IME2YJL106W 1938 nt7.31□□□□□ -1.24
SND1Q04007 REV7YIL139C 738 nt7.31□□□□□ -1.24
SND1Q04007 YMR074CYMR074C 438 nt7.31□□□□□ -1.24
SND1Q04007 LAG2YOL025W 1983 nt7.31□□□□□ -1.24
SND1Q04007 YHR140WYHR140W 720 nt7.3□□□□□ -1.24
SND1Q04007 GET4YOR164C 939 nt7.3□□□□□ -1.24
SND1Q04007 EXG2YDR261C 1689 nt7.3□□□□□ -1.24
SND1Q04007 CAN1YEL063C 1773 nt7.3□□□□□ -1.24
SND1Q04007 PAP1YKR002W 1707 nt7.3□□□□□ -1.24
SND1Q04007 NMD5YJR132W 3147 nt7.3□□□□□ -1.24
SND1Q04007 BNA3YJL060W 1335 nt7.29□□□□□ -1.24
SND1Q04007 RPL43AYPR043W 279 nt7.29□□□□□ -1.24
SND1Q04007 YPR130CYPR130C 408 nt7.29□□□□□ -1.24
SND1Q04007 IES1YFL013C 2079 nt7.29□□□□□ -1.24
SND1Q04007 CDC7YDL017W 1524 nt7.28□□□□□ -1.24
SND1Q04007 snR30snR30 606 nt7.28□□□□□ -1.24
SND1Q04007 NAF1YNL124W 1479 nt7.28□□□□□ -1.24
SND1Q04007 NUP57YGR119C 1626 nt7.27□□□□□ -1.25
SND1Q04007 GGC1YDL198C 903 nt7.27□□□□□ -1.25
SND1Q04007 PDA1YER178W 1263 nt7.27□□□□□ -1.25
SND1Q04007 YIP4YGL198W 708 nt7.27□□□□□ -1.25
SND1Q04007 LOT6YLR011W 576 nt7.27□□□□□ -1.25
SND1Q04007 ATO2YNR002C 849 nt7.27□□□□□ -1.25
SND1Q04007 YFR006WYFR006W 1608 nt7.27□□□□□ -1.25
SND1Q04007 RSC2YLR357W 2670 nt7.26□□□□□ -1.25
SND1Q04007 MCP1YOR228C 909 nt7.26□□□□□ -1.25
SND1Q04007 YCR061WYCR061W 1896 nt7.26□□□□□ -1.25
SND1Q04007 CDC11YJR076C 1248 nt7.25□□□□□ -1.25
SND1Q04007 YLR162WYLR162W 357 nt7.25□□□□□ -1.25
SND1Q04007 MSS116YDR194C 1995 nt7.25□□□□□ -1.25
SND1Q04007 PLB2YMR006C 2121 nt7.24□□□□□ -1.25
SND1Q04007 ZIM17YNL310C 525 nt7.24□□□□□ -1.25
SND1Q04007 LGE1YPL055C 999 nt7.24□□□□□ -1.25
SND1Q04007 PGI1YBR196C 1665 nt7.24□□□□□ -1.25
SND1Q04007 GUF1YLR289W 1938 nt7.23□□□□□ -1.25
SND1Q04007 CIA1YDR267C 993 nt7.23□□□□□ -1.25
SND1Q04007 DMC1YER179W 1005 nt7.23□□□□□ -1.25
SND1Q04007 ERG27YLR100W 1044 nt7.23□□□□□ -1.25
SND1Q04007 AAD14YNL331C 1131 nt7.23□□□□□ -1.25
SND1Q04007 CDC10YCR002C 969 nt7.22□□□□□ -1.25
SND1Q04007 SML1YML058W 315 nt7.22□□□□□ -1.25
SND1Q04007 YCL049CYCL049C 939 nt7.22□□□□□ -1.25
SND1Q04007 APM4YOL062C 1476 nt7.22□□□□□ -1.25
SND1Q04007 ARO10YDR380W 1908 nt7.21□□□□□ -1.25
SND1Q04007 SPE3YPR069C 882 nt7.21□□□□□ -1.26
SND1Q04007 PRP2YNR011C 2631 nt7.2□□□□□ -1.26
SND1Q04007 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.2□□□□□ -1.26
SND1Q04007 HTZ1YOL012C 405 nt7.2□□□□□ -1.26
SND1Q04007 DFR1YOR236W 636 nt7.2□□□□□ -1.26
SND1Q04007 MHP1YJL042W 4197 nt7.19□□□□□ -1.26
SND1Q04007 DEF1YKL054C 2217 nt7.19□□□□□ -1.26
SND1Q04007 BRN1YBL097W 2265 nt7.19□□□□□ -1.26
SND1Q04007 ADE17YMR120C 1779 nt7.19□□□□□ -1.26
SND1Q04007 YJL144WYJL144W 315 nt7.19□□□□□ -1.26
SND1Q04007 SUN4YNL066W 1263 nt7.19□□□□□ -1.26
SND1Q04007 YOR012WYOR012W 414 nt7.19□□□□□ -1.26
SND1Q04007 MPA43YNL249C 1629 nt7.19□□□□□ -1.26
SND1Q04007 COS6YGR295C 1146 nt7.18□□□□□ -1.26
SND1Q04007 YNR005CYNR005C 405 nt7.18□□□□□ -1.26
SND1Q04007 RFS1YBR052C 633 nt7.18□□□□□ -1.26
SND1Q04007 AIM3YBR108W 2844 nt7.17□□□□□ -1.26
SND1Q04007 TRP1YDR007W 675 nt7.17□□□□□ -1.26
SND1Q04007 PHO85YPL031C 918 nt7.17□□□□□ -1.26
SND1Q04007 CTF3YLR381W 2202 nt7.17□□□□□ -1.26
SND1Q04007 FET4YMR319C 1659 nt7.16□□□□□ -1.26
SND1Q04007 THR1YHR025W 1074 nt7.16□□□□□ -1.26
SND1Q04007 GPH1YPR160W 2709 nt7.16□□□□□ -1.26
SND1Q04007 BPL1YDL141W 2073 nt7.16□□□□□ -1.26
SND1Q04007 ERP5YHR110W 639 nt7.15□□□□□ -1.26
SND1Q04007 ERG10YPL028W 1197 nt7.15□□□□□ -1.26
SND1Q04007 APE4YHR113W 1473 nt7.15□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YJL163CYJL163C 1668 nt7.15□□□□□ -1.27
SND1Q04007 PLB3YOL011W 2061 nt7.15□□□□□ -1.27
SND1Q04007 VPS72YDR485C 2388 nt7.15□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YDL023CYDL023C 321 nt7.14□□□□□ -1.27
SND1Q04007 PUS4YNL292W 1212 nt7.14□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YOL099CYOL099C 492 nt7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms