Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 YML6YML025C 861 nt5.5□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 YMR074CYMR074C 438 nt5.5□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 YPL108WYPL108W 507 nt5.5□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 IMA5YJL216C 1746 nt5.5□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 PEX31YGR004W 1389 nt5.5□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 YPR084WYPR084W 1371 nt5.5□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 ESC8YOL017W 2145 nt5.5□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 YCR025CYCR025C 411 nt5.49□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 PPM1YDR435C 987 nt5.48□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 PGC1YPL206C 966 nt5.48□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 STE3YKL178C 1413 nt5.48□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 TPO3YPR156C 1869 nt5.47□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 PAC2YER007W 1557 nt5.47□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 COX5AYNL052W 462 nt5.47□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 IRS4YKR019C 1848 nt5.46□□□□□ -1.53
PKR1Q03880 AIM33YML087C 939 nt5.46□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 YOL099CYOL099C 492 nt5.46□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 YDR387CYDR387C 1668 nt5.46□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 SUB2YDL084W 1341 nt5.46□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 NAF1YNL124W 1479 nt5.45□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 DLD1YDL174C 1764 nt5.45□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 BZZ1YHR114W 1902 nt5.45□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 HIS1YER055C 894 nt5.45□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 YJL144WYJL144W 315 nt5.45□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 MSS1YMR023C 1581 nt5.45□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 LDB19YOR322C 2457 nt5.45□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 ATP2YJR121W 1536 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 GET2YER083C 858 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 YER156CYER156C 1017 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 OAC1YKL120W 975 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 ERG27YLR100W 1044 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 YNL295WYNL295W 1575 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 YBR232CYBR232C 360 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 RIX7YLL034C 2514 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 PSP2YML017W 1782 nt5.44□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.43□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 TRS31YDR472W 852 nt5.43□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 SHO1YER118C 1104 nt5.43□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 INP54YOL065C 1155 nt5.43□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 PAT1YCR077C 2391 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 DUG1YFR044C 1446 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 PCS60YBR222C 1632 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 DUS4YLR405W 1104 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 RPS6AYPL090C 711 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 RPS6BYBR181C 711 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 CTA1YDR256C 1548 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 IMA2YOL157C 1770 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 SES1YDR023W 1389 nt5.42□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 YDR514CYDR514C 1452 nt5.41□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 PAB1YER165W 1734 nt5.41□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 PFK2YMR205C 2880 nt5.41□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.41□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 POX1YGL205W 2247 nt5.41□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 QNS1YHR074W 2145 nt5.41□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 PAU15YIR041W 375 nt5.4□□□□□ -1.54
PKR1Q03880 TUF1YOR187W 1314 nt5.4□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 SKN1YGR143W 2316 nt5.4□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 CIT3YPR001W 1461 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 STB5YHR178W 2232 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 RRP43YCR035C 1185 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 TGA1tA(UGC)A 73 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 THR1YHR025W 1074 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YBR226CYBR226C 411 nt5.39□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 HAS1YMR290C 1518 nt5.38□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt5.38□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 GCN3YKR026C 918 nt5.38□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.38□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YPT10YBR264C 600 nt5.38□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 LSG1YGL099W 1923 nt5.37□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 ICS3YJL077C 396 nt5.37□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YJR107WYJR107W 987 nt5.37□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YKR032WYKR032W 315 nt5.37□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 CUE4YML101C 354 nt5.37□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 MSN2YMR037C 2115 nt5.37□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YBR124WYBR124W 360 nt5.37□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 CIT2YCR005C 1383 nt5.37□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 TRP5YGL026C 2124 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 PMT3YOR321W 2262 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 HSP150YJL159W 1242 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 MFT1YML062C 1179 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 CWC27YPL064C 906 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 FCY1YPR062W 477 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 ADH5YBR145W 1056 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 AFG1YEL052W 1530 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YPL247CYPL247C 1572 nt5.36□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YFL052WYFL052W 1398 nt5.35□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 RRP46YGR095C 672 nt5.35□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 DSC3YOR223W 879 nt5.35□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 STE13YOR219C 2796 nt5.35□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 GAA1YLR088W 1845 nt5.34□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 COX9YDL067C 180 nt5.34□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 HPT1YDR399W 666 nt5.34□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.34□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 TOS6YNL300W 309 nt5.34□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 MRP51YPL118W 1035 nt5.34□□□□□ -1.55
PKR1Q03880 MTC5YDR128W 3447 nt5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms