Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 TFC6YDR362C 2019 nt6.71□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 STE3YKL178C 1413 nt6.7□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 UTR5YEL035C 501 nt6.7□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 YUR1YJL139C 1287 nt6.7□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 YNL165WYNL165W 1221 nt6.7□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 PHO85YPL031C 918 nt6.7□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 GAA1YLR088W 1845 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 YIL055CYIL055C 1884 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 GET2YER083C 858 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 QCR6YFR033C 444 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 TAD2YJL035C 753 nt6.69□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 YBR284WYBR284W 2394 nt6.68□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 ATP2YJR121W 1536 nt6.68□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 HST2YPL015C 1074 nt6.68□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 COX16YJL003W 357 nt6.67□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 YPR127WYPR127W 1038 nt6.67□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 RDR1YOR380W 1641 nt6.67□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 RIO1YOR119C 1455 nt6.66□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 DAL4YIR028W 1908 nt6.66□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 YNL295WYNL295W 1575 nt6.66□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 SKI2YLR398C 3864 nt6.66□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 YLL058WYLL058W 1728 nt6.66□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 RAP1YNL216W 2484 nt6.66□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 CDC7YDL017W 1524 nt6.66□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 YNR014WYNR014W 639 nt6.65□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 GYP8YFL027C 1494 nt6.65□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 ELP4YPL101W 1371 nt6.64□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 MFG1YDL233W 1377 nt6.63□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 CEM1YER061C 1329 nt6.63□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 TIF2YJL138C 1188 nt6.63□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 TIF1YKR059W 1188 nt6.63□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.63□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 CYC8YBR112C 2901 nt6.63□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 IRC5YFR038W 2562 nt6.62□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 ADE1YAR015W 921 nt6.62□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 MIX17YMR002W 471 nt6.62□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 YMR074CYMR074C 438 nt6.62□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 MRPL28YDR462W 444 nt6.61□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 ERP2YAL007C 648 nt6.61□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 TDH1YJL052W 999 nt6.61□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 CDC11YJR076C 1248 nt6.61□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 SLA2YNL243W 2907 nt6.61□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 OPT1YJL212C 2400 nt6.6□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 RRP43YCR035C 1185 nt6.6□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.6□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 KAE1YKR038C 1161 nt6.6□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 PGI1YBR196C 1665 nt6.6□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 ACS1YAL054C 2142 nt6.59□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 POP1YNL221C 2628 nt6.59□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 YDR401WYDR401W 564 nt6.59□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 OST3YOR085W 1053 nt6.59□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 RPL5YPL131W 894 nt6.59□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 EFT2YDR385W 2529 nt6.59□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 EFT1YOR133W 2529 nt6.59□□□□□ -1.35
CIK1Q01649 snR82snR82 268 nt6.58□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 PPH22YDL188C 1134 nt6.58□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 YIL168WYIL168W 384 nt6.58□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 FUS3YBL016W 1062 nt6.58□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 PAP2YOL115W 1755 nt6.58□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 LAG2YOL025W 1983 nt6.58□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 MSN2YMR037C 2115 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 YBL070CYBL070C 321 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 YPT10YBR264C 600 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 NUP53YMR153W 1428 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 DLD1YDL174C 1764 nt6.57□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 GEF1YJR040W 2340 nt6.56□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 ORM1YGR038W 669 nt6.56□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 YGR127WYGR127W 939 nt6.56□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 AIM33YML087C 939 nt6.56□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 RPL43AYPR043W 279 nt6.56□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 IME2YJL106W 1938 nt6.56□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 MSG5YNL053W 1470 nt6.55□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 GUF1YLR289W 1938 nt6.54□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 JIP4YDR475C 2631 nt6.54□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 DSC3YOR223W 879 nt6.54□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 THR1YHR025W 1074 nt6.53□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 YJL144WYJL144W 315 nt6.53□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 PSP2YML017W 1782 nt6.53□□□□□ -1.36
CIK1Q01649 CIS3YJL158C 684 nt6.52□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 ERG27YLR100W 1044 nt6.52□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 SPS1YDR523C 1473 nt6.52□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 PET494YNR045W 1470 nt6.52□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 ARG81YML099C 2643 nt6.51□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 YOL099CYOL099C 492 nt6.51□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 ENP1YBR247C 1452 nt6.51□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 SPR1YOR190W 1338 nt6.5□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 PPM1YDR435C 987 nt6.5□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 THI4YGR144W 981 nt6.5□□□□□ -1.37
CIK1Q01649 DYS1YHR068W 1164 nt6.5□□□□□ -1.37
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