Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 TPK1YJL164C 1194 nt6.6□□□□□ -1.35
MDE1P47095 YKL147CYKL147C 618 nt6.6□□□□□ -1.35
MDE1P47095 FUS3YBL016W 1062 nt6.6□□□□□ -1.35
MDE1P47095 MSI1YBR195C 1269 nt6.6□□□□□ -1.35
MDE1P47095 CYC8YBR112C 2901 nt6.6□□□□□ -1.35
MDE1P47095 BDF2YDL070W 1917 nt6.6□□□□□ -1.35
MDE1P47095 IRS4YKR019C 1848 nt6.6□□□□□ -1.35
MDE1P47095 NMT1YLR195C 1368 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 HRB1YNL004W 1365 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 YGL260WYGL260W 231 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 PIL1YGR086C 1020 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 YJL213WYJL213W 996 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 PAM17YKR065C 594 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 CYB2YML054C 1776 nt6.59□□□□□ -1.35
MDE1P47095 EXG2YDR261C 1689 nt6.58□□□□□ -1.36
MDE1P47095 NUP57YGR119C 1626 nt6.58□□□□□ -1.36
MDE1P47095 GTT3YEL017W 1014 nt6.58□□□□□ -1.36
MDE1P47095 LIP5YOR196C 1245 nt6.58□□□□□ -1.36
MDE1P47095 YOR343CYOR343C 327 nt6.58□□□□□ -1.36
MDE1P47095 HXT2YMR011W 1626 nt6.58□□□□□ -1.36
MDE1P47095 TKL2YBR117C 2046 nt6.57□□□□□ -1.36
MDE1P47095 DFR1YOR236W 636 nt6.57□□□□□ -1.36
MDE1P47095 PET494YNR045W 1470 nt6.57□□□□□ -1.36
MDE1P47095 NOG2YNR053C 1461 nt6.57□□□□□ -1.36
MDE1P47095 CTF8YHR191C 402 nt6.56□□□□□ -1.36
MDE1P47095 FCY22YER060W-A 1593 nt6.56□□□□□ -1.36
MDE1P47095 MSS1YMR023C 1581 nt6.56□□□□□ -1.36
MDE1P47095 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.55□□□□□ -1.36
MDE1P47095 CCW12YLR110C 402 nt6.55□□□□□ -1.36
MDE1P47095 HST2YPL015C 1074 nt6.55□□□□□ -1.36
MDE1P47095 PET117YER058W 324 nt6.54□□□□□ -1.36
MDE1P47095 COG1YGL223C 1254 nt6.54□□□□□ -1.36
MDE1P47095 YNL200CYNL200C 741 nt6.54□□□□□ -1.36
MDE1P47095 SDH8YBR269C 417 nt6.54□□□□□ -1.36
MDE1P47095 MHP1YJL042W 4197 nt6.54□□□□□ -1.36
MDE1P47095 NMA2YGR010W 1188 nt6.53□□□□□ -1.36
MDE1P47095 YLR358CYLR358C 564 nt6.53□□□□□ -1.36
MDE1P47095 RPL43AYPR043W 279 nt6.53□□□□□ -1.36
MDE1P47095 TFB4YPR056W 1017 nt6.53□□□□□ -1.36
MDE1P47095 CDC3YLR314C 1563 nt6.52□□□□□ -1.36
MDE1P47095 HXT17YNR072W 1695 nt6.52□□□□□ -1.37
MDE1P47095 BUD20YLR074C 501 nt6.52□□□□□ -1.37
MDE1P47095 MCH2YKL221W 1422 nt6.51□□□□□ -1.37
MDE1P47095 ERP2YAL007C 648 nt6.51□□□□□ -1.37
MDE1P47095 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.51□□□□□ -1.37
MDE1P47095 CIT2YCR005C 1383 nt6.51□□□□□ -1.37
MDE1P47095 CEF1YMR213W 1773 nt6.51□□□□□ -1.37
MDE1P47095 DEF1YKL054C 2217 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 EFT2YDR385W 2529 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 EFT1YOR133W 2529 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 YBR241CYBR241C 1467 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 ARP3YJR065C 1350 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 YPQ2YDR352W 954 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 HSP12YFL014W 330 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 YML122CYML122C 381 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 CDC7YDL017W 1524 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 RAP1YNL216W 2484 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 TUB1YML085C 1344 nt6.5□□□□□ -1.37
MDE1P47095 SLX5YDL013W 1860 nt6.49□□□□□ -1.37
MDE1P47095 YDL023CYDL023C 321 nt6.49□□□□□ -1.37
MDE1P47095 RPL2BYIL018W 765 nt6.49□□□□□ -1.37
MDE1P47095 YMR074CYMR074C 438 nt6.49□□□□□ -1.37
MDE1P47095 ARC35YNR035C 1029 nt6.49□□□□□ -1.37
MDE1P47095 SRP101YDR292C 1866 nt6.49□□□□□ -1.37
MDE1P47095 NCA3YJL116C 1014 nt6.48□□□□□ -1.37
MDE1P47095 SUN4YNL066W 1263 nt6.48□□□□□ -1.37
MDE1P47095 OPI11YPR044C 354 nt6.48□□□□□ -1.37
MDE1P47095 CCT3YJL014W 1605 nt6.47□□□□□ -1.37
MDE1P47095 YDR401WYDR401W 564 nt6.47□□□□□ -1.37
MDE1P47095 YAL045CYAL045C 309 nt6.47□□□□□ -1.37
MDE1P47095 PHO3YBR092C 1404 nt6.47□□□□□ -1.37
MDE1P47095 LAG2YOL025W 1983 nt6.46□□□□□ -1.37
MDE1P47095 SUR7YML052W 909 nt6.46□□□□□ -1.38
MDE1P47095 DPM1YPR183W 804 nt6.46□□□□□ -1.38
MDE1P47095 RDR1YOR380W 1641 nt6.46□□□□□ -1.38
MDE1P47095 DOC1YGL240W 753 nt6.45□□□□□ -1.38
MDE1P47095 YPR127WYPR127W 1038 nt6.45□□□□□ -1.38
MDE1P47095 DML1YMR211W 1428 nt6.44□□□□□ -1.38
MDE1P47095 TAH11YJR046W 1815 nt6.44□□□□□ -1.38
MDE1P47095 MPE1YKL059C 1326 nt6.44□□□□□ -1.38
MDE1P47095 ACS1YAL054C 2142 nt6.43□□□□□ -1.38
MDE1P47095 ISC1YER019W 1434 nt6.42□□□□□ -1.38
MDE1P47095 CSC1YLR241W 2349 nt6.42□□□□□ -1.38
MDE1P47095 ERS1YCR075C 783 nt6.42□□□□□ -1.38
MDE1P47095 TRP5YGL026C 2124 nt6.42□□□□□ -1.38
MDE1P47095 ASN1YPR145W 1719 nt6.42□□□□□ -1.38
MDE1P47095 NFS1YCL017C 1494 nt6.41□□□□□ -1.38
MDE1P47095 SEC18YBR080C 2277 nt6.41□□□□□ -1.38
MDE1P47095 MTR3YGR158C 753 nt6.41□□□□□ -1.38
MDE1P47095 ATP23YNR020C 813 nt6.41□□□□□ -1.38
MDE1P47095 PGI1YBR196C 1665 nt6.41□□□□□ -1.38
MDE1P47095 HIS7YBR248C 1659 nt6.41□□□□□ -1.38
MDE1P47095 KDX1YKL161C 1302 nt6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.4 ms