Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 YIL092WYIL092W 1902 nt6.89□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 GFA1YKL104C 2154 nt6.89□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 RGT2YDL138W 2292 nt6.89□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 AIM3YBR108W 2844 nt6.89□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 HAL5YJL165C 2568 nt6.88□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 BRN1YBL097W 2265 nt6.88□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 GLN3YER040W 2193 nt6.88□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 YNR048WYNR048W 1182 nt6.88□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 YBR232CYBR232C 360 nt6.88□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 GPH1YPR160W 2709 nt6.87□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 YNL200CYNL200C 741 nt6.87□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 GDA1YEL042W 1557 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 GPA1YHR005C 1419 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 RRP43YCR035C 1185 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 NTG1YAL015C 1200 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 SUN4YNL066W 1263 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 AIM41YOR215C 558 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 CYB2YML054C 1776 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 POP1YNL221C 2628 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 GAT1YFL021W 1533 nt6.86□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.85□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.85□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.85□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.85□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.85□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.85□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 AVT4YNL101W 2142 nt6.85□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 POX1YGL205W 2247 nt6.84□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 ARC35YNR035C 1029 nt6.84□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 FCY1YPR062W 477 nt6.84□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 GSH1YJL101C 2037 nt6.84□□□□□ -1.31
SSZ1P38788 ARO10YDR380W 1908 nt6.84□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 NMT1YLR195C 1368 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 YLL066CYLL066C 3618 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 MTR3YGR158C 753 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 MRPL24YMR193W 777 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 PHO85YPL031C 918 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 SNT309YPR101W 528 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 HXK2YGL253W 1461 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 APM4YOL062C 1476 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 RDR1YOR380W 1641 nt6.83□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 PCL10YGL134W 1302 nt6.82□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 PAU15YIR041W 375 nt6.82□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 TAH11YJR046W 1815 nt6.82□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 EFT2YDR385W 2529 nt6.82□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 EFT1YOR133W 2529 nt6.82□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 YER147C-AYER147C-A 411 nt6.81□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt6.81□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 CEF1YMR213W 1773 nt6.81□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 FCY22YER060W-A 1593 nt6.81□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 CDC7YDL017W 1524 nt6.81□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 PET494YNR045W 1470 nt6.8□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 YGR127WYGR127W 939 nt6.8□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 AMN1YBR158W 1650 nt6.8□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 RBS1YDL189W 1374 nt6.8□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 YMR074CYMR074C 438 nt6.79□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 YPT10YBR264C 600 nt6.79□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 CCT3YJL014W 1605 nt6.79□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 TDP1YBR223C 1635 nt6.79□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 SKG1YKR100C 1068 nt6.78□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 YOL079WYOL079W 399 nt6.78□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 HST2YPL015C 1074 nt6.78□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 YPR127WYPR127W 1038 nt6.78□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 ECM38YLR299W 1983 nt6.78□□□□□ -1.32
SSZ1P38788 RPL2BYIL018W 765 nt6.77□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 YJL160CYJL160C 864 nt6.77□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 RSA3YLR221C 663 nt6.77□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 TAF4YMR005W 1167 nt6.77□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 DSE3YOR264W 1293 nt6.77□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 YIL055CYIL055C 1884 nt6.77□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 LAG2YOL025W 1983 nt6.77□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 ERS1YCR075C 783 nt6.76□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.76□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 THI4YGR144W 981 nt6.76□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 DPH5YLR172C 903 nt6.76□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 DSC3YOR223W 879 nt6.76□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 SPS1YDR523C 1473 nt6.76□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 PGI1YBR196C 1665 nt6.76□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 ACS1YAL054C 2142 nt6.75□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 MOD5YOR274W 1287 nt6.75□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 HBN1YCL026C-B 582 nt6.75□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 DIT1YDR403W 1611 nt6.75□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 PRP40YKL012W 1752 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 YBR138CYBR138C 1575 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 BDF2YDL070W 1917 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 GYP8YFL027C 1494 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 PSA1YDL055C 1086 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 snR82snR82 268 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 YHP1YDR451C 1062 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 LYS12YIL094C 1116 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 YIL168WYIL168W 384 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 YAL045CYAL045C 309 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 DRS1YLL008W 2259 nt6.74□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 EAF5YEL018W 840 nt6.73□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 MFT1YML062C 1179 nt6.73□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 FET4YMR319C 1659 nt6.73□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 PXL1YKR090W 2121 nt6.73□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 ARP3YJR065C 1350 nt6.72□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 CTF8YHR191C 402 nt6.72□□□□□ -1.33
SSZ1P38788 MIX17YMR002W 471 nt6.72□□□□□ -1.33
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