Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCNTO95613 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCNTO95613 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCNTO95613 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCNTO95613 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCNTO95613 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCNTO95613 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCNTO95613 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCNTO95613 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCNTO95613 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCNTO95613 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCNTO95613 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCNTO95613 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCNTO95613 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCNTO95613 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PCNTO95613 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCNTO95613 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCNTO95613 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCNTO95613 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCNTO95613 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCNTO95613 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCNTO95613 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCNTO95613 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCNTO95613 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PCNTO95613 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PCNTO95613 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCNTO95613 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCNTO95613 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PCNTO95613 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PCNTO95613 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCNTO95613 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCNTO95613 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCNTO95613 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCNTO95613 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCNTO95613 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCNTO95613 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCNTO95613 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCNTO95613 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCNTO95613 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCNTO95613 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PCNTO95613 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCNTO95613 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PCNTO95613 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCNTO95613 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PCNTO95613 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PCNTO95613 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PCNTO95613 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCNTO95613 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCNTO95613 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCNTO95613 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCNTO95613 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCNTO95613 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCNTO95613 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCNTO95613 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCNTO95613 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCNTO95613 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCNTO95613 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCNTO95613 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCNTO95613 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PCNTO95613 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCNTO95613 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCNTO95613 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCNTO95613 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCNTO95613 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCNTO95613 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCNTO95613 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCNTO95613 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PCNTO95613 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCNTO95613 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCNTO95613 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PCNTO95613 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCNTO95613 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCNTO95613 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCNTO95613 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCNTO95613 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PCNTO95613 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCNTO95613 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCNTO95613 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PCNTO95613 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCNTO95613 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCNTO95613 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCNTO95613 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCNTO95613 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCNTO95613 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCNTO95613 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCNTO95613 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCNTO95613 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCNTO95613 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCNTO95613 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCNTO95613 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCNTO95613 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCNTO95613 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCNTO95613 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCNTO95613 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCNTO95613 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCNTO95613 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCNTO95613 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCNTO95613 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCNTO95613 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCNTO95613 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms