Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms