Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms