Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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