Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SFTPBP07988 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPBP07988 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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