Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VPREB3Q9UKI3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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