Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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