Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL3Q9NYJ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL3Q9NYJ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms