Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6AQ9NPB6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6AQ9NPB6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms