Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU0

CNTNAP3B, Contactin-associated protein-like 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3BQ96NU0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP3BQ96NU0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP3BQ96NU0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3BQ96NU0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3BQ96NU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP3BQ96NU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP3BQ96NU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP3BQ96NU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP3BQ96NU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP3BQ96NU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms