Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD2Q96M20 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD2Q96M20 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNBD2Q96M20 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms