Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTU1Q7Z7A3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTU1Q7Z7A3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTU1Q7Z7A3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTU1Q7Z7A3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms