Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 AFG3YER017C 2286 nt6.93□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 BAP3YDR046C 1815 nt6.93□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 GTS1YGL181W 1191 nt6.93□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 YJL213WYJL213W 996 nt6.93□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 REC114YMR133W 1287 nt6.92□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 ATP23YNR020C 813 nt6.92□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 CDC16YKL022C 2523 nt6.92□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 YNL040WYNL040W 1371 nt6.92□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 GFA1YKL104C 2154 nt6.91□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 URH1YDR400W 1023 nt6.91□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 YML122CYML122C 381 nt6.91□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 YKR018CYKR018C 2178 nt6.91□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 CDC23YHR166C 1881 nt6.9□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 PIH1YHR034C 1035 nt6.9□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 DPH5YLR172C 903 nt6.9□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 YML079WYML079W 606 nt6.9□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 YBR226CYBR226C 411 nt6.9□□□□□ -1.3
NMD4Q12129 RBS1YDL189W 1374 nt6.9□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 YGL260WYGL260W 231 nt6.89□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 YKL147CYKL147C 618 nt6.89□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 ADH6YMR318C 1083 nt6.89□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 MSS51YLR203C 1311 nt6.89□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 HXT13YEL069C 1695 nt6.88□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 EHD3YDR036C 1503 nt6.88□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 YER137CYER137C 447 nt6.88□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 PRE5YMR314W 705 nt6.88□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 YBL111CYBL111C 2004 nt6.88□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 CIT2YCR005C 1383 nt6.87□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 BNA3YJL060W 1335 nt6.87□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 PET117YER058W 324 nt6.87□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 LIP5YOR196C 1245 nt6.87□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.86□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 SDH8YBR269C 417 nt6.86□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 CDC13YDL220C 2775 nt6.85□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 SEC24YIL109C 2781 nt6.85□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 RRP46YGR095C 672 nt6.85□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 YNL017CYNL017C 339 nt6.85□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 PRB1YEL060C 1908 nt6.85□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 FCP1YMR277W 2199 nt6.85□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 CAN1YEL063C 1773 nt6.85□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 RDR1YOR380W 1641 nt6.84□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 TUB1YML085C 1344 nt6.84□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 YPQ2YDR352W 954 nt6.84□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 LCP5YER127W 1074 nt6.84□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 ATG17YLR423C 1254 nt6.84□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 PTH2YBL057C 627 nt6.84□□□□□ -1.31
NMD4Q12129 CDC7YDL017W 1524 nt6.83□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 TRR2YHR106W 1029 nt6.83□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 YMR074CYMR074C 438 nt6.83□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 YPL067CYPL067C 597 nt6.83□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 DML1YMR211W 1428 nt6.83□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 BNS1YGR230W 414 nt6.82□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 PUP2YGR253C 783 nt6.82□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.82□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 RPL43AYPR043W 279 nt6.82□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 DPM1YPR183W 804 nt6.82□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 FLC2YAL053W 2352 nt6.82□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 NFS1YCL017C 1494 nt6.81□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 BUD9YGR041W 1644 nt6.81□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 MSB3YNL293W 1902 nt6.81□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 POX1YGL205W 2247 nt6.81□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 YEN1YER041W 2280 nt6.8□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 TOD6YBL054W 1578 nt6.8□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 PRS4YBL068W 981 nt6.8□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 YPQ1YOL092W 927 nt6.8□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 RMD8YFR048W 1989 nt6.8□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 UME1YPL139C 1383 nt6.8□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 MPE1YKL059C 1326 nt6.79□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.79□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 RPR1RPR1 369 nt6.79□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 ELP3YPL086C 1674 nt6.78□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 RTC4YNL254C 1206 nt6.78□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 PGI1YBR196C 1665 nt6.77□□□□□ -1.32
NMD4Q12129 NUP57YGR119C 1626 nt6.77□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 CST26YBR042C 1194 nt6.77□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 MFG1YDL233W 1377 nt6.77□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 GDA1YEL042W 1557 nt6.77□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 FCY2YER056C 1602 nt6.76□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 PPS1YBR276C 2424 nt6.76□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 ERG27YLR100W 1044 nt6.76□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 LAT1YNL071W 1449 nt6.76□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 CYS3YAL012W 1185 nt6.75□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 SUN4YNL066W 1263 nt6.75□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 GET4YOR164C 939 nt6.75□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 MBF1YOR298C-A 456 nt6.75□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 CIR2YOR356W 1896 nt6.75□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 EXG2YDR261C 1689 nt6.74□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 YOX1YML027W 1158 nt6.74□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 YPR130CYPR130C 408 nt6.74□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 MHP1YJL042W 4197 nt6.73□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 DMC1YER179W 1005 nt6.73□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 YJL211CYJL211C 444 nt6.73□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.73□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 ENB1YOL158C 1821 nt6.72□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.72□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 LOT6YLR011W 576 nt6.72□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 PLB2YMR006C 2121 nt6.72□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 RFS1YBR052C 633 nt6.72□□□□□ -1.33
NMD4Q12129 THR1YHR025W 1074 nt6.71□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 AIM46YHR199C 933 nt6.71□□□□□ -1.34
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