Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 CDC3YLR314C 1563 nt7.25□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 PET18YCR020C 648 nt7.25□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 FHN1YGR131W 525 nt7.25□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 CYB2YML054C 1776 nt7.25□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 GSH1YJL101C 2037 nt7.22□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 TOS2YGR221C 1869 nt7.22□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 YIA6YIL006W 1122 nt7.22□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 YAH1YPL252C 519 nt7.22□□□□□ -1.25
YKU80Q04437 YLL066CYLL066C 3618 nt7.21□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 YDR327WYDR327W 327 nt7.21□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 GRH1YDR517W 1119 nt7.21□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 MCH2YKL221W 1422 nt7.2□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 YNL017CYNL017C 339 nt7.2□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 ATP2YJR121W 1536 nt7.19□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 MFT1YML062C 1179 nt7.19□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 ARC35YNR035C 1029 nt7.19□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 CSM2YIL132C 642 nt7.18□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 YPC1YBR183W 951 nt7.18□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 HSM3YBR272C 1443 nt7.18□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 ECM38YLR299W 1983 nt7.17□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 GLN3YER040W 2193 nt7.17□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 ADE17YMR120C 1779 nt7.16□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 FPR2YDR519W 408 nt7.16□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 CPR2YHR057C 618 nt7.16□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 RPL2BYIL018W 765 nt7.15□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 YIL168WYIL168W 384 nt7.15□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.15□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 RIB1YBL033C 1038 nt7.15□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 PRP2YNR011C 2631 nt7.15□□□□□ -1.26
YKU80Q04437 BDF2YDL070W 1917 nt7.15□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 POX1YGL205W 2247 nt7.15□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 UTR5YEL035C 501 nt7.14□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 CTF8YHR191C 402 nt7.14□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 VMA2YBR127C 1554 nt7.14□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 TAH11YJR046W 1815 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 BUD9YGR041W 1644 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 CCT3YJL014W 1605 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 GDA1YEL042W 1557 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 RRP46YGR095C 672 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 MTR3YGR158C 753 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 SOD2YHR008C 702 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 DAL80YKR034W 810 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 RGT2YDL138W 2292 nt7.13□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 ADA2YDR448W 1305 nt7.12□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 YNL165WYNL165W 1221 nt7.12□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 ATP4YPL078C 735 nt7.12□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 OPI11YPR044C 354 nt7.12□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 SNT309YPR101W 528 nt7.12□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 ARP3YJR065C 1350 nt7.11□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 ERS1YCR075C 783 nt7.11□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 YAL045CYAL045C 309 nt7.11□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 STE3YKL178C 1413 nt7.1□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 YIP4YGL198W 708 nt7.1□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 YBR241CYBR241C 1467 nt7.1□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 URH1YDR400W 1023 nt7.09□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 HSP12YFL014W 330 nt7.09□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 HMS2YJR147W 1077 nt7.09□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 INP54YOL065C 1155 nt7.09□□□□□ -1.27
YKU80Q04437 YNL295WYNL295W 1575 nt7.08□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 ERG24YNL280C 1317 nt7.08□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 GTT3YEL017W 1014 nt7.08□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 HGH1YGR187C 1185 nt7.08□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 TDH1YJL052W 999 nt7.08□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 AMN1YBR158W 1650 nt7.08□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 GET2YER083C 858 nt7.07□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 SUR7YML052W 909 nt7.07□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 REC114YMR133W 1287 nt7.07□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 GPA1YHR005C 1419 nt7.07□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 AVT4YNL101W 2142 nt7.06□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 TAD2YJL035C 753 nt7.06□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 GDH1YOR375C 1365 nt7.06□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 ELP4YPL101W 1371 nt7.06□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 ELP3YPL086C 1674 nt7.06□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 RRP43YCR035C 1185 nt7.05□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 MRP1YDR347W 966 nt7.05□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.05□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 OPI1YHL020C 1215 nt7.04□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 SUN4YNL066W 1263 nt7.04□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 HBN1YCL026C-B 582 nt7.04□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 CHS5YLR330W 2016 nt7.03□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 PHO3YBR092C 1404 nt7.03□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 YGR139WYGR139W 339 nt7.03□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 TPK1YJL164C 1194 nt7.03□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 PHO85YPL031C 918 nt7.03□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 YPT10YBR264C 600 nt7.03□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 FCY22YER060W-A 1593 nt7.03□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 CEM1YER061C 1329 nt7.02□□□□□ -1.28
YKU80Q04437 RDR1YOR380W 1641 nt7.02□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 OPI8YKR035C 642 nt7.02□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 YNL200CYNL200C 741 nt7.02□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 SPR1YOR190W 1338 nt7.01□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 NSE5YML023C 1671 nt7.01□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 PSA1YDL055C 1086 nt7.01□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 YNR014WYNR014W 639 nt7.01□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 BDS1YOL164W 1941 nt7.01□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 TDP1YBR223C 1635 nt7.01□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 SLA2YNL243W 2907 nt7□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 MHP1YJL042W 4197 nt7□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 AIM3YBR108W 2844 nt7□□□□□ -1.29
YKU80Q04437 PAU21YOR394W 495 nt7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.8 ms