Protein–RNA interactions for Protein: Q03390

VPS60, Vacuolar protein-sorting-associated protein 60, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS60Q03390 TDH1YJL052W 999 nt7.71□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 MIX17YMR002W 471 nt7.71□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 GLN3YER040W 2193 nt7.71□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 CEM1YER061C 1329 nt7.71□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 ARP3YJR065C 1350 nt7.71□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 PNS1YOR161C 1620 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 PSP2YML017W 1782 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 ERG27YLR100W 1044 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 RPL43AYPR043W 279 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 HBN1YCL026C-B 582 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 IRC5YFR038W 2562 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 HSM3YBR272C 1443 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 MRPL28YDR462W 444 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 STS1YIR011C 960 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 PAU19YMR325W 375 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 OSM1YJR051W 1506 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 VMA2YBR127C 1554 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 HMS2YJR147W 1077 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 CCW12YLR110C 402 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 SUR7YML052W 909 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 DLD1YDL174C 1764 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 SEN2YLR105C 1134 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 YMR007WYMR007W 381 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 CPT1YNL130C 1182 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 GUT1YHL032C 2130 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 THR1YHR025W 1074 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 YJL213WYJL213W 996 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 HOG1YLR113W 1308 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 PET117YER058W 324 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 HEL1YKR017C 1656 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS60Q03390 OPI8YKR035C 642 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 MSG5YNL053W 1470 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 COX16YJL003W 357 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 YNR014WYNR014W 639 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 SDH8YBR269C 417 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 CTA1YDR256C 1548 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 PHO3YBR092C 1404 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 HRB1YNL004W 1365 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 TPK1YJL164C 1194 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 ADA2YDR448W 1305 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 YCP4YCR004C 744 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 HAC1YFL031W 717 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 RCR1YBR005W 642 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 YJR142WYJR142W 1029 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 FCY22YER060W-A 1593 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 HPT1YDR399W 666 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 YOL099CYOL099C 492 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 NOG2YNR053C 1461 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS60Q03390 TUF1YOR187W 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 PIL1YGR086C 1020 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 PPH22YDL188C 1134 nt7.57□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 DMC1YER179W 1005 nt7.57□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 SLA2YNL243W 2907 nt7.57□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 CIT2YCR005C 1383 nt7.57□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 AVT4YNL101W 2142 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 YNL200CYNL200C 741 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 DPM1YPR183W 804 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 ECM27YJR106W 2178 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 STF1YDL130W-A 261 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 RPL5YPL131W 894 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 ELP4YPL101W 1371 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 KNS1YLL019C 2214 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 CRN1YLR429W 1956 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 PAC2YER007W 1557 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 RGD2YFL047W 2145 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 YCR049CYCR049C 447 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 TKL2YBR117C 2046 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS60Q03390 YPL247CYPL247C 1572 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 TAD2YJL035C 753 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 NMA2YGR010W 1188 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 YUR1YJL139C 1287 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 PAM17YKR065C 594 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 NUP53YMR153W 1428 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 YDR306CYDR306C 1437 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 ISC1YER019W 1434 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 SGE1YPR198W 1632 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 CEF1YMR213W 1773 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 YGL081WYGL081W 963 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 DYS1YHR068W 1164 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 MSI1YBR195C 1269 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 PEX31YGR004W 1389 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 MLS1YNL117W 1665 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 RTC4YNL254C 1206 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS60Q03390 TRS31YDR472W 852 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 YJL144WYJL144W 315 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 GDH1YOR375C 1365 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 PRP2YNR011C 2631 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 GCN3YKR026C 918 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 AIM33YML087C 939 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 CIR2YOR356W 1896 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 NCA3YJL116C 1014 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 CUE4YML101C 354 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 HXT2YMR011W 1626 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS60Q03390 ARG81YML099C 2643 nt7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 116 ms