Protein–RNA interactions for Protein: Q01080

RPA49, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPA49Q01080 PGI1YBR196C 1665 nt7.51□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 DMC1YER179W 1005 nt7.51□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 MLS1YNL117W 1665 nt7.51□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 YKR018CYKR018C 2178 nt7.5□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 ERG27YLR100W 1044 nt7.5□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 SPE3YPR069C 882 nt7.5□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 YCL049CYCL049C 939 nt7.5□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 SML1YML058W 315 nt7.49□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 AAD14YNL331C 1131 nt7.49□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 ERR3YMR323W 1314 nt7.48□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 CAN1YEL063C 1773 nt7.47□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 CHA1YCL064C 1083 nt7.47□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 YJL144WYJL144W 315 nt7.47□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 MGM101YJR144W 810 nt7.47□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 HTZ1YOL012C 405 nt7.47□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 RMD8YFR048W 1989 nt7.47□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 BRN1YBL097W 2265 nt7.47□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 SEC24YIL109C 2781 nt7.46□□□□□ -1.21
RPA49Q01080 FCY2YER056C 1602 nt7.45□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 EXG2YDR261C 1689 nt7.45□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 YNR005CYNR005C 405 nt7.45□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 RTG2YGL252C 1767 nt7.45□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 NUP57YGR119C 1626 nt7.45□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 ECM27YJR106W 2178 nt7.44□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 PRB1YEL060C 1908 nt7.44□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 ENB1YOL158C 1821 nt7.43□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 MET30YIL046W 1923 nt7.43□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 YCR049CYCR049C 447 nt7.43□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 SUN4YNL066W 1263 nt7.43□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 YNL190WYNL190W 615 nt7.43□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.43□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 PLB3YOL011W 2061 nt7.42□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 ALR1YOL130W 2580 nt7.42□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 THR1YHR025W 1074 nt7.42□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 PUS4YNL292W 1212 nt7.42□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 YJL163CYJL163C 1668 nt7.41□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 MHP1YJL042W 4197 nt7.41□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 YOL046CYOL046C 675 nt7.41□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 YOL099CYOL099C 492 nt7.41□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 ERG10YPL028W 1197 nt7.41□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 PHO85YPL031C 918 nt7.41□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 YPR076WYPR076W 375 nt7.41□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 SNU66YOR308C 1764 nt7.41□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 LDB7YBL006C 543 nt7.4□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 BIO3YNR058W 1443 nt7.4□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 APE4YHR113W 1473 nt7.4□□□□□ -1.22
RPA49Q01080 MPH3YJR160C 1809 nt7.4□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 LAS17YOR181W 1902 nt7.4□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 TOD6YBL054W 1578 nt7.39□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 ERR1YOR393W 1314 nt7.39□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 ERR2YPL281C 1314 nt7.39□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 LOT6YLR011W 576 nt7.39□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 NTG2YOL043C 1143 nt7.39□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 ADE2YOR128C 1716 nt7.38□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 HPT1YDR399W 666 nt7.38□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 YAL045CYAL045C 309 nt7.38□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 FIT2YOR382W 462 nt7.38□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 YPR127WYPR127W 1038 nt7.38□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 CTA1YDR256C 1548 nt7.37□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 ATP10YLR393W 840 nt7.37□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 YPL041CYPL041C 624 nt7.37□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 YER137CYER137C 447 nt7.36□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 YMR253CYMR253C 1245 nt7.36□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 AGX1YFL030W 1158 nt7.35□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 CYS4YGR155W 1524 nt7.35□□□□□ -1.23
RPA49Q01080 GCD11YER025W 1584 nt7.33□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 DLD1YDL174C 1764 nt7.33□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 PPH21YDL134C 1110 nt7.33□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 HOC1YJR075W 1191 nt7.33□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 NUP84YDL116W 2181 nt7.33□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 IRC5YFR038W 2562 nt7.32□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 COX15YER141W 1461 nt7.32□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 YGL102CYGL102C 429 nt7.32□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 YOR111WYOR111W 699 nt7.32□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 YCR041WYCR041W 333 nt7.31□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 LIA1YJR070C 978 nt7.31□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 MIX17YMR002W 471 nt7.31□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 POB3YML069W 1659 nt7.31□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 YIP4YGL198W 708 nt7.3□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 PTC7YHR076W 1032 nt7.3□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 YLL056CYLL056C 897 nt7.3□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 MRPL19YNL185C 477 nt7.3□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 MSG5YNL053W 1470 nt7.3□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 FCY22YER060W-A 1593 nt7.29□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 GPD1YDL022W 1176 nt7.29□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 SNF4YGL115W 969 nt7.29□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 REC107YJR021C 945 nt7.29□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 ASR1YPR093C 867 nt7.29□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 TDP1YBR223C 1635 nt7.29□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 UBP13YBL067C 2244 nt7.29□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 YLL058WYLL058W 1728 nt7.29□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 MRPL35YDR322W 1104 nt7.28□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 SSC1YJR045C 1965 nt7.28□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 NUP49YGL172W 1419 nt7.27□□□□□ -1.24
RPA49Q01080 ICP55YER078C 1536 nt7.27□□□□□ -1.25
RPA49Q01080 YLR112WYLR112W 420 nt7.27□□□□□ -1.25
RPA49Q01080 SMX3YPR182W 261 nt7.27□□□□□ -1.25
RPA49Q01080 AQR1YNL065W 1761 nt7.27□□□□□ -1.25
RPA49Q01080 VBA5YKR105C 1749 nt7.27□□□□□ -1.25
RPA49Q01080 BNA3YJL060W 1335 nt7.27□□□□□ -1.25
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