Protein–RNA interactions for Protein: P53852

YNL247W, Cysteine--tRNA ligase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL247WP53852 MAL31YBR298C 1845 nt7.52□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 SEC24YIL109C 2781 nt7.52□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 ERG12YMR208W 1332 nt7.52□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 TCB1YOR086C 3561 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 GTS1YGL181W 1191 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 CCW12YLR110C 402 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 PRE5YMR314W 705 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 YOR041CYOR041C 432 nt7.51□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 TOD6YBL054W 1578 nt7.5□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 YML122CYML122C 381 nt7.5□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 PIH1YHR034C 1035 nt7.49□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 YML079WYML079W 606 nt7.49□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 AFG3YER017C 2286 nt7.49□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 MSS51YLR203C 1311 nt7.47□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 GPA1YHR005C 1419 nt7.46□□□□□ -1.21
YNL247WP53852 PET117YER058W 324 nt7.46□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 QCR6YFR033C 444 nt7.46□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 RFS1YBR052C 633 nt7.46□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 CDC23YHR166C 1881 nt7.46□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 CIT2YCR005C 1383 nt7.46□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 YPQ2YDR352W 954 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 DPH5YLR172C 903 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 SDH8YBR269C 417 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 RMD8YFR048W 1989 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 TUB1YML085C 1344 nt7.45□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 YLL058WYLL058W 1728 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 TRR2YHR106W 1029 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 YKL147CYKL147C 618 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 PTH2YBL057C 627 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 DML1YMR211W 1428 nt7.44□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 YGL260WYGL260W 231 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 LIP5YOR196C 1245 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 SRF1YDL133W 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 VBA5YKR105C 1749 nt7.43□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.42□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 PUP2YGR253C 783 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 PRS4YBL068W 981 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 CAN1YEL063C 1773 nt7.41□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 ECM30YLR436C 3825 nt7.4□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 YPL067CYPL067C 597 nt7.4□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 RPL43AYPR043W 279 nt7.4□□□□□ -1.22
YNL247WP53852 MFG1YDL233W 1377 nt7.39□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 MPE1YKL059C 1326 nt7.39□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 CDC7YDL017W 1524 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 NFS1YCL017C 1494 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 YMR074CYMR074C 438 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 DPM1YPR183W 804 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 RDR1YOR380W 1641 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 RGT2YDL138W 2292 nt7.38□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 TPK1YJL164C 1194 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 RPR1RPR1 369 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 CST26YBR042C 1194 nt7.37□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 LAT1YNL071W 1449 nt7.36□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 YHR131CYHR131C 2553 nt7.36□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 UME1YPL139C 1383 nt7.36□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 MEU1YLR017W 1014 nt7.36□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 YPQ1YOL092W 927 nt7.36□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 YOX1YML027W 1158 nt7.34□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 RTC4YNL254C 1206 nt7.34□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 RQC1YDR333C 2172 nt7.34□□□□□ -1.23
YNL247WP53852 FLC2YAL053W 2352 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 HMS2YJR147W 1077 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 AIM3YBR108W 2844 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 NUP57YGR119C 1626 nt7.32□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 MHP1YJL042W 4197 nt7.32□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 GET4YOR164C 939 nt7.32□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 SKY1YMR216C 2229 nt7.32□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 PGI1YBR196C 1665 nt7.32□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 AIM46YHR199C 933 nt7.31□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 ERP2YAL007C 648 nt7.31□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 EMP65YER140W 1671 nt7.31□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 FCY2YER056C 1602 nt7.3□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 HGH1YGR187C 1185 nt7.3□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 CYS3YAL012W 1185 nt7.3□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 MBF1YOR298C-A 456 nt7.3□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 HAL5YJL165C 2568 nt7.3□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 ERG27YLR100W 1044 nt7.29□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 SUN4YNL066W 1263 nt7.29□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 YPR130CYPR130C 408 nt7.29□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 SEC23YPR181C 2307 nt7.29□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 PLB2YMR006C 2121 nt7.28□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 UBP13YBL067C 2244 nt7.28□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 RSP5YER125W 2430 nt7.28□□□□□ -1.24
YNL247WP53852 snR30snR30 606 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 EFM1YHL039W 1758 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 HOG1YLR113W 1308 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 KIN1YDR122W 3195 nt7.26□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 YCR041WYCR041W 333 nt7.26□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 CIA1YDR267C 993 nt7.26□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 DMC1YER179W 1005 nt7.26□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 THR1YHR025W 1074 nt7.26□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 YPR127WYPR127W 1038 nt7.26□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 NAF1YNL124W 1479 nt7.25□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 EXG2YDR261C 1689 nt7.25□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 ENB1YOL158C 1821 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 LOT6YLR011W 576 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 YLR162WYLR162W 357 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL247WP53852 HTZ1YOL012C 405 nt7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.7 ms