Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFBP49765 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
VEGFBP49765 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VEGFBP49765 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms