Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMTP48728 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMTP48728 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMTP48728 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMTP48728 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMTP48728 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMTP48728 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AMTP48728 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AMTP48728 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AMTP48728 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AMTP48728 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AMTP48728 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AMTP48728 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMTP48728 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMTP48728 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMTP48728 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMTP48728 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMTP48728 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AMTP48728 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMTP48728 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMTP48728 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AMTP48728 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMTP48728 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMTP48728 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMTP48728 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMTP48728 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMTP48728 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMTP48728 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMTP48728 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMTP48728 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMTP48728 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMTP48728 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMTP48728 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMTP48728 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMTP48728 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMTP48728 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMTP48728 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMTP48728 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMTP48728 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMTP48728 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMTP48728 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMTP48728 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMTP48728 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMTP48728 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMTP48728 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMTP48728 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMTP48728 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMTP48728 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMTP48728 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AMTP48728 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AMTP48728 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMTP48728 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMTP48728 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMTP48728 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMTP48728 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMTP48728 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMTP48728 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMTP48728 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AMTP48728 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMTP48728 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMTP48728 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMTP48728 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMTP48728 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMTP48728 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMTP48728 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMTP48728 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMTP48728 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.6 ms