Protein–RNA interactions for Protein: P36534

MRPL40, 54S ribosomal protein L40, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL40P36534 DML1YMR211W 1428 nt7.31□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 PMT1YDL095W 2454 nt7.3□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 SGE1YPR198W 1632 nt7.3□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 YPQ2YDR352W 954 nt7.3□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 RCF2YNR018W 675 nt7.3□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 DAL7YIR031C 1665 nt7.3□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 CCW12YLR110C 402 nt7.29□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 VPS65YLR322W 315 nt7.29□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 PMT7YDR307W 1989 nt7.29□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 MET13YGL125W 1803 nt7.29□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 SRY1YKL218C 981 nt7.28□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 SPE3YPR069C 882 nt7.28□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 LEO1YOR123C 1395 nt7.28□□□□□ -1.24
MRPL40P36534 LGE1YPL055C 999 nt7.27□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 CIT2YCR005C 1383 nt7.27□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 TUB1YML085C 1344 nt7.27□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 PUS4YNL292W 1212 nt7.26□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 YAH1YPL252C 519 nt7.26□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 RSC9YML127W 1746 nt7.26□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 BIM1YER016W 1035 nt7.25□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 RTC2YBR147W 891 nt7.25□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 PDC5YLR134W 1692 nt7.25□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 ERG12YMR208W 1332 nt7.25□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 ERG24YNL280C 1317 nt7.25□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 NFS1YCL017C 1494 nt7.24□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 ZIM17YNL310C 525 nt7.24□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 PLB3YOL011W 2061 nt7.24□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 NAF1YNL124W 1479 nt7.23□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 DCR2YLR361C 1737 nt7.22□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.22□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 snR30snR30 606 nt7.22□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 RUP1YOR138C 2016 nt7.22□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 HXT9YJL219W 1704 nt7.21□□□□□ -1.25
MRPL40P36534 PAB1YER165W 1734 nt7.21□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 PET117YER058W 324 nt7.2□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 RTC4YNL254C 1206 nt7.2□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 MPE1YKL059C 1326 nt7.2□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 CIR2YOR356W 1896 nt7.19□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 YDR327WYDR327W 327 nt7.19□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 PDA1YER178W 1263 nt7.19□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 SML1YML058W 315 nt7.19□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 TPI1YDR050C 747 nt7.18□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 YLR162WYLR162W 357 nt7.18□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 GET4YOR164C 939 nt7.17□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 SGF73YGL066W 1974 nt7.17□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 AFG3YER017C 2286 nt7.16□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.16□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 ERG10YPL028W 1197 nt7.16□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 DPM1YPR183W 804 nt7.16□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 PPS1YBR276C 2424 nt7.16□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 HAL5YJL165C 2568 nt7.15□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 SSC1YJR045C 1965 nt7.15□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 POR2YIL114C 846 nt7.15□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 SNA3YJL151C 402 nt7.15□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 YPR130CYPR130C 408 nt7.15□□□□□ -1.26
MRPL40P36534 YEN1YER041W 2280 nt7.14□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 HNM1YGL077C 1692 nt7.14□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 BNA3YJL060W 1335 nt7.14□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YKR023WYKR023W 1593 nt7.14□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 DPH5YLR172C 903 nt7.14□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YCL049CYCL049C 939 nt7.14□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YOR389WYOR389W 1875 nt7.13□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 CYS4YGR155W 1524 nt7.13□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 TCB1YOR086C 3561 nt7.12□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 BIO3YNR058W 1443 nt7.12□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 DAL4YIR028W 1908 nt7.12□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 CIA1YDR267C 993 nt7.12□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YER137CYER137C 447 nt7.12□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.12□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 SPG1YGR236C 288 nt7.12□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 MPH3YJR160C 1809 nt7.12□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 HTZ1YOL012C 405 nt7.11□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 PLB2YMR006C 2121 nt7.1□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YBL113CYBL113C 2379 nt7.1□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YJL163CYJL163C 1668 nt7.1□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 QCR6YFR033C 444 nt7.1□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 TPK1YJL164C 1194 nt7.1□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 LDB7YBL006C 543 nt7.1□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 SGV1YPR161C 1974 nt7.09□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YGL260WYGL260W 231 nt7.09□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 YMR074CYMR074C 438 nt7.09□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 RPL43AYPR043W 279 nt7.09□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 VBA5YKR105C 1749 nt7.09□□□□□ -1.27
MRPL40P36534 GNA1YFL017C 480 nt7.08□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 HMS2YJR147W 1077 nt7.08□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 COX15YER141W 1461 nt7.08□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 APE4YHR113W 1473 nt7.07□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 YKL147CYKL147C 618 nt7.07□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.07□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 YOL046CYOL046C 675 nt7.07□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 YPR076WYPR076W 375 nt7.07□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 ECM30YLR436C 3825 nt7.07□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 YLL058WYLL058W 1728 nt7.07□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 EMP65YER140W 1671 nt7.06□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 RDR1YOR380W 1641 nt7.06□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 MEU1YLR017W 1014 nt7.06□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 FIT2YOR382W 462 nt7.06□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 DMC1YER179W 1005 nt7.05□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 HDA1YNL021W 2121 nt7.05□□□□□ -1.28
MRPL40P36534 YOR300WYOR300W 309 nt7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 112 ms