Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BMI1P35226 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BMI1P35226 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BMI1P35226 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BMI1P35226 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BMI1P35226 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BMI1P35226 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BMI1P35226 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BMI1P35226 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BMI1P35226 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BMI1P35226 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BMI1P35226 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BMI1P35226 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BMI1P35226 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BMI1P35226 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BMI1P35226 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BMI1P35226 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BMI1P35226 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BMI1P35226 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BMI1P35226 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BMI1P35226 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BMI1P35226 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BMI1P35226 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BMI1P35226 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BMI1P35226 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMI1P35226 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMI1P35226 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMI1P35226 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMI1P35226 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMI1P35226 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMI1P35226 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMI1P35226 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMI1P35226 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMI1P35226 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMI1P35226 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMI1P35226 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BMI1P35226 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMI1P35226 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMI1P35226 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMI1P35226 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMI1P35226 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMI1P35226 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BMI1P35226 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BMI1P35226 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BMI1P35226 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BMI1P35226 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BMI1P35226 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BMI1P35226 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMI1P35226 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMI1P35226 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMI1P35226 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMI1P35226 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMI1P35226 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BMI1P35226 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMI1P35226 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms