Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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HIF1AQ16665 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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HIF1AQ16665 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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