Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms