Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC24CP53992 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms