Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRYD3Q8NCJ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms