Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPARGC1BQ86YN6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms