Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TK1P04183 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TK1P04183 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TK1P04183 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms