Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF18Q9UNG2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF18Q9UNG2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF18Q9UNG2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms