Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXL3Q9UKT7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL3Q9UKT7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXL3Q9UKT7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms