Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A4Q9UKG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A4Q9UKG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A4Q9UKG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC13A4Q9UKG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms