Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RDH8Q9NYR8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH8Q9NYR8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH8Q9NYR8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms