Protein–RNA interactions for Protein: Q9H425

C1orf198, Uncharacterized protein C1orf198, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf198Q9H425 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf198Q9H425 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf198Q9H425 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf198Q9H425 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf198Q9H425 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf198Q9H425 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf198Q9H425 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf198Q9H425 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms