Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GORASP1Q9BQQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GORASP1Q9BQQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms